Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dsg1cQ7TSF0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms