Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPD6

Raver2, Ribonucleoprotein PTB-binding 2, mousemouse

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Raver2Q7TPD6 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Raver2Q7TPD6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Raver2Q7TPD6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Raver2Q7TPD6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Raver2Q7TPD6 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Raver2Q7TPD6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Raver2Q7TPD6 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Raver2Q7TPD6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Raver2Q7TPD6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Raver2Q7TPD6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Raver2Q7TPD6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Raver2Q7TPD6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Raver2Q7TPD6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Raver2Q7TPD6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Raver2Q7TPD6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Raver2Q7TPD6 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Raver2Q7TPD6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Raver2Q7TPD6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Raver2Q7TPD6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Raver2Q7TPD6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Raver2Q7TPD6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Raver2Q7TPD6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Raver2Q7TPD6 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Raver2Q7TPD6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Raver2Q7TPD6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Raver2Q7TPD6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Raver2Q7TPD6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Raver2Q7TPD6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Raver2Q7TPD6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Raver2Q7TPD6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Raver2Q7TPD6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Raver2Q7TPD6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Raver2Q7TPD6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Raver2Q7TPD6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Raver2Q7TPD6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Raver2Q7TPD6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Raver2Q7TPD6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Raver2Q7TPD6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Raver2Q7TPD6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Raver2Q7TPD6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Raver2Q7TPD6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Raver2Q7TPD6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Raver2Q7TPD6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Raver2Q7TPD6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Raver2Q7TPD6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Raver2Q7TPD6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Raver2Q7TPD6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Raver2Q7TPD6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Raver2Q7TPD6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Raver2Q7TPD6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Raver2Q7TPD6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Raver2Q7TPD6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Raver2Q7TPD6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Raver2Q7TPD6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Raver2Q7TPD6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Raver2Q7TPD6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Raver2Q7TPD6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Raver2Q7TPD6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Raver2Q7TPD6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Raver2Q7TPD6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Raver2Q7TPD6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Raver2Q7TPD6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Raver2Q7TPD6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Raver2Q7TPD6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Raver2Q7TPD6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Raver2Q7TPD6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Raver2Q7TPD6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Raver2Q7TPD6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Raver2Q7TPD6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Raver2Q7TPD6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Raver2Q7TPD6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Raver2Q7TPD6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Raver2Q7TPD6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Raver2Q7TPD6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Raver2Q7TPD6 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Raver2Q7TPD6 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Raver2Q7TPD6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Raver2Q7TPD6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Raver2Q7TPD6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Raver2Q7TPD6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Raver2Q7TPD6 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Raver2Q7TPD6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Raver2Q7TPD6 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Raver2Q7TPD6 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Raver2Q7TPD6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Raver2Q7TPD6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Raver2Q7TPD6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Raver2Q7TPD6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Raver2Q7TPD6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Raver2Q7TPD6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Raver2Q7TPD6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Raver2Q7TPD6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Raver2Q7TPD6 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Raver2Q7TPD6 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Raver2Q7TPD6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Raver2Q7TPD6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Raver2Q7TPD6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Raver2Q7TPD6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Raver2Q7TPD6 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Raver2Q7TPD6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms