Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN29

Smap2, Stromal membrane-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smap2Q7TN29 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smap2Q7TN29 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smap2Q7TN29 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smap2Q7TN29 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smap2Q7TN29 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smap2Q7TN29 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smap2Q7TN29 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smap2Q7TN29 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smap2Q7TN29 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smap2Q7TN29 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smap2Q7TN29 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smap2Q7TN29 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smap2Q7TN29 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smap2Q7TN29 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smap2Q7TN29 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smap2Q7TN29 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smap2Q7TN29 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smap2Q7TN29 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smap2Q7TN29 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Smap2Q7TN29 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Smap2Q7TN29 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smap2Q7TN29 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smap2Q7TN29 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smap2Q7TN29 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smap2Q7TN29 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smap2Q7TN29 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smap2Q7TN29 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smap2Q7TN29 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smap2Q7TN29 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smap2Q7TN29 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smap2Q7TN29 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms