Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ScocQ78YZ6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ScocQ78YZ6 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ScocQ78YZ6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ScocQ78YZ6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ScocQ78YZ6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ScocQ78YZ6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ScocQ78YZ6 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ScocQ78YZ6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ScocQ78YZ6 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ScocQ78YZ6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ScocQ78YZ6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ScocQ78YZ6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ScocQ78YZ6 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ScocQ78YZ6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ScocQ78YZ6 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ScocQ78YZ6 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ScocQ78YZ6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ScocQ78YZ6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ScocQ78YZ6 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ScocQ78YZ6 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ScocQ78YZ6 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ScocQ78YZ6 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ScocQ78YZ6 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ScocQ78YZ6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ScocQ78YZ6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ScocQ78YZ6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ScocQ78YZ6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ScocQ78YZ6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ScocQ78YZ6 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ScocQ78YZ6 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ScocQ78YZ6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ScocQ78YZ6 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ScocQ78YZ6 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ScocQ78YZ6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ScocQ78YZ6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ScocQ78YZ6 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ScocQ78YZ6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ScocQ78YZ6 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ScocQ78YZ6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ScocQ78YZ6 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ScocQ78YZ6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ScocQ78YZ6 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ScocQ78YZ6 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ScocQ78YZ6 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ScocQ78YZ6 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ScocQ78YZ6 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ScocQ78YZ6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ScocQ78YZ6 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ScocQ78YZ6 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ScocQ78YZ6 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ScocQ78YZ6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ScocQ78YZ6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ScocQ78YZ6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ScocQ78YZ6 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ScocQ78YZ6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ScocQ78YZ6 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ScocQ78YZ6 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ScocQ78YZ6 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ScocQ78YZ6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ScocQ78YZ6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ScocQ78YZ6 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ScocQ78YZ6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ScocQ78YZ6 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ScocQ78YZ6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ScocQ78YZ6 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ScocQ78YZ6 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ScocQ78YZ6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ScocQ78YZ6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ScocQ78YZ6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ScocQ78YZ6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ScocQ78YZ6 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ScocQ78YZ6 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ScocQ78YZ6 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ScocQ78YZ6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ScocQ78YZ6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ScocQ78YZ6 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ScocQ78YZ6 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ScocQ78YZ6 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ScocQ78YZ6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ScocQ78YZ6 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ScocQ78YZ6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ScocQ78YZ6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ScocQ78YZ6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ScocQ78YZ6 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ScocQ78YZ6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ScocQ78YZ6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ScocQ78YZ6 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ScocQ78YZ6 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ScocQ78YZ6 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ScocQ78YZ6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ScocQ78YZ6 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ScocQ78YZ6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ScocQ78YZ6 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ScocQ78YZ6 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ScocQ78YZ6 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ScocQ78YZ6 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ScocQ78YZ6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ScocQ78YZ6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ScocQ78YZ6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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