Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQE4

Nemp1, Nuclear envelope integral membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nemp1Q6ZQE4 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nemp1Q6ZQE4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nemp1Q6ZQE4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nemp1Q6ZQE4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nemp1Q6ZQE4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nemp1Q6ZQE4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nemp1Q6ZQE4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nemp1Q6ZQE4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nemp1Q6ZQE4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nemp1Q6ZQE4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nemp1Q6ZQE4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nemp1Q6ZQE4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nemp1Q6ZQE4 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nemp1Q6ZQE4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nemp1Q6ZQE4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nemp1Q6ZQE4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Nemp1Q6ZQE4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nemp1Q6ZQE4 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nemp1Q6ZQE4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nemp1Q6ZQE4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nemp1Q6ZQE4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nemp1Q6ZQE4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nemp1Q6ZQE4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nemp1Q6ZQE4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nemp1Q6ZQE4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nemp1Q6ZQE4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nemp1Q6ZQE4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nemp1Q6ZQE4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nemp1Q6ZQE4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Nemp1Q6ZQE4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Nemp1Q6ZQE4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nemp1Q6ZQE4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nemp1Q6ZQE4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nemp1Q6ZQE4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nemp1Q6ZQE4 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nemp1Q6ZQE4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nemp1Q6ZQE4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nemp1Q6ZQE4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nemp1Q6ZQE4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nemp1Q6ZQE4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Nemp1Q6ZQE4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nemp1Q6ZQE4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nemp1Q6ZQE4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nemp1Q6ZQE4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nemp1Q6ZQE4 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nemp1Q6ZQE4 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nemp1Q6ZQE4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nemp1Q6ZQE4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nemp1Q6ZQE4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nemp1Q6ZQE4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nemp1Q6ZQE4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nemp1Q6ZQE4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nemp1Q6ZQE4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nemp1Q6ZQE4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nemp1Q6ZQE4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nemp1Q6ZQE4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nemp1Q6ZQE4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nemp1Q6ZQE4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nemp1Q6ZQE4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nemp1Q6ZQE4 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nemp1Q6ZQE4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nemp1Q6ZQE4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nemp1Q6ZQE4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nemp1Q6ZQE4 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nemp1Q6ZQE4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nemp1Q6ZQE4 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nemp1Q6ZQE4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nemp1Q6ZQE4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nemp1Q6ZQE4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nemp1Q6ZQE4 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nemp1Q6ZQE4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nemp1Q6ZQE4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nemp1Q6ZQE4 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Nemp1Q6ZQE4 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nemp1Q6ZQE4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nemp1Q6ZQE4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nemp1Q6ZQE4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nemp1Q6ZQE4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nemp1Q6ZQE4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nemp1Q6ZQE4 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nemp1Q6ZQE4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Nemp1Q6ZQE4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Nemp1Q6ZQE4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nemp1Q6ZQE4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Nemp1Q6ZQE4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nemp1Q6ZQE4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Nemp1Q6ZQE4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nemp1Q6ZQE4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nemp1Q6ZQE4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Nemp1Q6ZQE4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nemp1Q6ZQE4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Nemp1Q6ZQE4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nemp1Q6ZQE4 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nemp1Q6ZQE4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nemp1Q6ZQE4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nemp1Q6ZQE4 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Nemp1Q6ZQE4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nemp1Q6ZQE4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nemp1Q6ZQE4 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nemp1Q6ZQE4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms