Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ12

Ninl, Ninein-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinlQ6ZQ12 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NinlQ6ZQ12 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NinlQ6ZQ12 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NinlQ6ZQ12 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NinlQ6ZQ12 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NinlQ6ZQ12 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NinlQ6ZQ12 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NinlQ6ZQ12 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NinlQ6ZQ12 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NinlQ6ZQ12 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NinlQ6ZQ12 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NinlQ6ZQ12 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NinlQ6ZQ12 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NinlQ6ZQ12 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NinlQ6ZQ12 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NinlQ6ZQ12 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NinlQ6ZQ12 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NinlQ6ZQ12 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NinlQ6ZQ12 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NinlQ6ZQ12 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NinlQ6ZQ12 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NinlQ6ZQ12 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NinlQ6ZQ12 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NinlQ6ZQ12 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NinlQ6ZQ12 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
NinlQ6ZQ12 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NinlQ6ZQ12 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
NinlQ6ZQ12 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NinlQ6ZQ12 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NinlQ6ZQ12 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NinlQ6ZQ12 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NinlQ6ZQ12 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NinlQ6ZQ12 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NinlQ6ZQ12 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NinlQ6ZQ12 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NinlQ6ZQ12 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NinlQ6ZQ12 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NinlQ6ZQ12 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NinlQ6ZQ12 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NinlQ6ZQ12 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NinlQ6ZQ12 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NinlQ6ZQ12 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NinlQ6ZQ12 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NinlQ6ZQ12 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NinlQ6ZQ12 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NinlQ6ZQ12 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NinlQ6ZQ12 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NinlQ6ZQ12 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NinlQ6ZQ12 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NinlQ6ZQ12 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NinlQ6ZQ12 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NinlQ6ZQ12 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NinlQ6ZQ12 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NinlQ6ZQ12 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NinlQ6ZQ12 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NinlQ6ZQ12 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NinlQ6ZQ12 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NinlQ6ZQ12 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NinlQ6ZQ12 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NinlQ6ZQ12 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NinlQ6ZQ12 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NinlQ6ZQ12 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NinlQ6ZQ12 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NinlQ6ZQ12 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NinlQ6ZQ12 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NinlQ6ZQ12 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NinlQ6ZQ12 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NinlQ6ZQ12 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NinlQ6ZQ12 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NinlQ6ZQ12 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NinlQ6ZQ12 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NinlQ6ZQ12 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NinlQ6ZQ12 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NinlQ6ZQ12 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NinlQ6ZQ12 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NinlQ6ZQ12 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NinlQ6ZQ12 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NinlQ6ZQ12 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NinlQ6ZQ12 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NinlQ6ZQ12 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NinlQ6ZQ12 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NinlQ6ZQ12 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NinlQ6ZQ12 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NinlQ6ZQ12 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NinlQ6ZQ12 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NinlQ6ZQ12 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NinlQ6ZQ12 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NinlQ6ZQ12 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NinlQ6ZQ12 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NinlQ6ZQ12 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NinlQ6ZQ12 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NinlQ6ZQ12 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NinlQ6ZQ12 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NinlQ6ZQ12 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NinlQ6ZQ12 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NinlQ6ZQ12 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NinlQ6ZQ12 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NinlQ6ZQ12 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NinlQ6ZQ12 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NinlQ6ZQ12 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
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