Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp8b3Q6UQ17 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp8b3Q6UQ17 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp8b3Q6UQ17 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp8b3Q6UQ17 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp8b3Q6UQ17 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp8b3Q6UQ17 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp8b3Q6UQ17 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp8b3Q6UQ17 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp8b3Q6UQ17 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp8b3Q6UQ17 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atp8b3Q6UQ17 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atp8b3Q6UQ17 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atp8b3Q6UQ17 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Atp8b3Q6UQ17 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atp8b3Q6UQ17 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atp8b3Q6UQ17 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atp8b3Q6UQ17 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atp8b3Q6UQ17 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Atp8b3Q6UQ17 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Atp8b3Q6UQ17 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Atp8b3Q6UQ17 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Atp8b3Q6UQ17 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Atp8b3Q6UQ17 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Atp8b3Q6UQ17 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp8b3Q6UQ17 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp8b3Q6UQ17 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp8b3Q6UQ17 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp8b3Q6UQ17 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp8b3Q6UQ17 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp8b3Q6UQ17 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp8b3Q6UQ17 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp8b3Q6UQ17 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp8b3Q6UQ17 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp8b3Q6UQ17 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp8b3Q6UQ17 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp8b3Q6UQ17 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp8b3Q6UQ17 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp8b3Q6UQ17 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp8b3Q6UQ17 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp8b3Q6UQ17 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp8b3Q6UQ17 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp8b3Q6UQ17 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp8b3Q6UQ17 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp8b3Q6UQ17 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp8b3Q6UQ17 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp8b3Q6UQ17 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp8b3Q6UQ17 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp8b3Q6UQ17 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp8b3Q6UQ17 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp8b3Q6UQ17 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp8b3Q6UQ17 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp8b3Q6UQ17 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp8b3Q6UQ17 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp8b3Q6UQ17 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp8b3Q6UQ17 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp8b3Q6UQ17 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp8b3Q6UQ17 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp8b3Q6UQ17 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp8b3Q6UQ17 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp8b3Q6UQ17 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp8b3Q6UQ17 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp8b3Q6UQ17 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp8b3Q6UQ17 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp8b3Q6UQ17 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp8b3Q6UQ17 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp8b3Q6UQ17 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp8b3Q6UQ17 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp8b3Q6UQ17 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp8b3Q6UQ17 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp8b3Q6UQ17 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp8b3Q6UQ17 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp8b3Q6UQ17 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp8b3Q6UQ17 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp8b3Q6UQ17 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp8b3Q6UQ17 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp8b3Q6UQ17 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp8b3Q6UQ17 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp8b3Q6UQ17 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp8b3Q6UQ17 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp8b3Q6UQ17 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp8b3Q6UQ17 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp8b3Q6UQ17 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp8b3Q6UQ17 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp8b3Q6UQ17 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp8b3Q6UQ17 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp8b3Q6UQ17 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp8b3Q6UQ17 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp8b3Q6UQ17 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp8b3Q6UQ17 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp8b3Q6UQ17 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp8b3Q6UQ17 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp8b3Q6UQ17 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp8b3Q6UQ17 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp8b3Q6UQ17 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp8b3Q6UQ17 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp8b3Q6UQ17 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp8b3Q6UQ17 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp8b3Q6UQ17 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp8b3Q6UQ17 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms