Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS0

Vstm2l, V-set and transmembrane domain-containing protein 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2lQ6PDS0 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms