Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDC0

Rundc3b, RUN domain-containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc3bQ6PDC0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rundc3bQ6PDC0 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rundc3bQ6PDC0 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rundc3bQ6PDC0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rundc3bQ6PDC0 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rundc3bQ6PDC0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rundc3bQ6PDC0 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rundc3bQ6PDC0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rundc3bQ6PDC0 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rundc3bQ6PDC0 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rundc3bQ6PDC0 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Rundc3bQ6PDC0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Rundc3bQ6PDC0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rundc3bQ6PDC0 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rundc3bQ6PDC0 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rundc3bQ6PDC0 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rundc3bQ6PDC0 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rundc3bQ6PDC0 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rundc3bQ6PDC0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rundc3bQ6PDC0 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rundc3bQ6PDC0 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rundc3bQ6PDC0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rundc3bQ6PDC0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rundc3bQ6PDC0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rundc3bQ6PDC0 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rundc3bQ6PDC0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rundc3bQ6PDC0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rundc3bQ6PDC0 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rundc3bQ6PDC0 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rundc3bQ6PDC0 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rundc3bQ6PDC0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rundc3bQ6PDC0 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rundc3bQ6PDC0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rundc3bQ6PDC0 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Rundc3bQ6PDC0 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rundc3bQ6PDC0 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rundc3bQ6PDC0 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rundc3bQ6PDC0 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rundc3bQ6PDC0 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rundc3bQ6PDC0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rundc3bQ6PDC0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rundc3bQ6PDC0 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rundc3bQ6PDC0 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rundc3bQ6PDC0 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rundc3bQ6PDC0 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rundc3bQ6PDC0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rundc3bQ6PDC0 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rundc3bQ6PDC0 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rundc3bQ6PDC0 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rundc3bQ6PDC0 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rundc3bQ6PDC0 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rundc3bQ6PDC0 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rundc3bQ6PDC0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rundc3bQ6PDC0 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rundc3bQ6PDC0 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rundc3bQ6PDC0 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rundc3bQ6PDC0 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rundc3bQ6PDC0 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rundc3bQ6PDC0 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rundc3bQ6PDC0 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rundc3bQ6PDC0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rundc3bQ6PDC0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rundc3bQ6PDC0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rundc3bQ6PDC0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rundc3bQ6PDC0 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rundc3bQ6PDC0 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rundc3bQ6PDC0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rundc3bQ6PDC0 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rundc3bQ6PDC0 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rundc3bQ6PDC0 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rundc3bQ6PDC0 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rundc3bQ6PDC0 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rundc3bQ6PDC0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rundc3bQ6PDC0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rundc3bQ6PDC0 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rundc3bQ6PDC0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rundc3bQ6PDC0 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rundc3bQ6PDC0 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rundc3bQ6PDC0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rundc3bQ6PDC0 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rundc3bQ6PDC0 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rundc3bQ6PDC0 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rundc3bQ6PDC0 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rundc3bQ6PDC0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rundc3bQ6PDC0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rundc3bQ6PDC0 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rundc3bQ6PDC0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rundc3bQ6PDC0 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rundc3bQ6PDC0 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rundc3bQ6PDC0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rundc3bQ6PDC0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rundc3bQ6PDC0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rundc3bQ6PDC0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rundc3bQ6PDC0 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rundc3bQ6PDC0 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rundc3bQ6PDC0 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rundc3bQ6PDC0 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rundc3bQ6PDC0 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rundc3bQ6PDC0 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rundc3bQ6PDC0 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms