Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trak1Q6PD31 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Trak1Q6PD31 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Trak1Q6PD31 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Trak1Q6PD31 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Trak1Q6PD31 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Trak1Q6PD31 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Trak1Q6PD31 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Trak1Q6PD31 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Trak1Q6PD31 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trak1Q6PD31 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trak1Q6PD31 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trak1Q6PD31 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trak1Q6PD31 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trak1Q6PD31 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trak1Q6PD31 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trak1Q6PD31 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trak1Q6PD31 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trak1Q6PD31 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trak1Q6PD31 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trak1Q6PD31 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trak1Q6PD31 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Trak1Q6PD31 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Trak1Q6PD31 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trak1Q6PD31 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trak1Q6PD31 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trak1Q6PD31 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Trak1Q6PD31 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trak1Q6PD31 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trak1Q6PD31 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trak1Q6PD31 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trak1Q6PD31 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Trak1Q6PD31 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trak1Q6PD31 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trak1Q6PD31 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trak1Q6PD31 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trak1Q6PD31 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trak1Q6PD31 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trak1Q6PD31 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trak1Q6PD31 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trak1Q6PD31 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trak1Q6PD31 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trak1Q6PD31 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trak1Q6PD31 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trak1Q6PD31 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trak1Q6PD31 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trak1Q6PD31 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trak1Q6PD31 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trak1Q6PD31 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trak1Q6PD31 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trak1Q6PD31 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trak1Q6PD31 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trak1Q6PD31 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Trak1Q6PD31 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Trak1Q6PD31 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Trak1Q6PD31 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Trak1Q6PD31 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Trak1Q6PD31 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Trak1Q6PD31 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Trak1Q6PD31 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Trak1Q6PD31 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trak1Q6PD31 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trak1Q6PD31 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trak1Q6PD31 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trak1Q6PD31 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trak1Q6PD31 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trak1Q6PD31 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trak1Q6PD31 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trak1Q6PD31 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trak1Q6PD31 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trak1Q6PD31 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trak1Q6PD31 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trak1Q6PD31 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trak1Q6PD31 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trak1Q6PD31 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trak1Q6PD31 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trak1Q6PD31 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trak1Q6PD31 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trak1Q6PD31 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trak1Q6PD31 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trak1Q6PD31 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trak1Q6PD31 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trak1Q6PD31 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Trak1Q6PD31 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trak1Q6PD31 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trak1Q6PD31 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trak1Q6PD31 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trak1Q6PD31 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trak1Q6PD31 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trak1Q6PD31 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trak1Q6PD31 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trak1Q6PD31 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trak1Q6PD31 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trak1Q6PD31 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trak1Q6PD31 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trak1Q6PD31 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trak1Q6PD31 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trak1Q6PD31 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Trak1Q6PD31 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trak1Q6PD31 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms