Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9P0

Slf2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slf2Q6P9P0 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slf2Q6P9P0 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slf2Q6P9P0 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slf2Q6P9P0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slf2Q6P9P0 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slf2Q6P9P0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slf2Q6P9P0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slf2Q6P9P0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slf2Q6P9P0 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slf2Q6P9P0 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slf2Q6P9P0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slf2Q6P9P0 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slf2Q6P9P0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slf2Q6P9P0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slf2Q6P9P0 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slf2Q6P9P0 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slf2Q6P9P0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Slf2Q6P9P0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Slf2Q6P9P0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Slf2Q6P9P0 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slf2Q6P9P0 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Slf2Q6P9P0 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slf2Q6P9P0 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slf2Q6P9P0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slf2Q6P9P0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slf2Q6P9P0 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slf2Q6P9P0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slf2Q6P9P0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slf2Q6P9P0 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slf2Q6P9P0 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Slf2Q6P9P0 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slf2Q6P9P0 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slf2Q6P9P0 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slf2Q6P9P0 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slf2Q6P9P0 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slf2Q6P9P0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slf2Q6P9P0 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slf2Q6P9P0 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slf2Q6P9P0 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slf2Q6P9P0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slf2Q6P9P0 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slf2Q6P9P0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slf2Q6P9P0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slf2Q6P9P0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slf2Q6P9P0 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slf2Q6P9P0 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Slf2Q6P9P0 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slf2Q6P9P0 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slf2Q6P9P0 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slf2Q6P9P0 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slf2Q6P9P0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slf2Q6P9P0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slf2Q6P9P0 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slf2Q6P9P0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slf2Q6P9P0 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slf2Q6P9P0 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slf2Q6P9P0 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slf2Q6P9P0 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slf2Q6P9P0 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slf2Q6P9P0 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slf2Q6P9P0 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slf2Q6P9P0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slf2Q6P9P0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slf2Q6P9P0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slf2Q6P9P0 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slf2Q6P9P0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slf2Q6P9P0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slf2Q6P9P0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slf2Q6P9P0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slf2Q6P9P0 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Slf2Q6P9P0 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slf2Q6P9P0 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slf2Q6P9P0 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slf2Q6P9P0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slf2Q6P9P0 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slf2Q6P9P0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slf2Q6P9P0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slf2Q6P9P0 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slf2Q6P9P0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slf2Q6P9P0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slf2Q6P9P0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Slf2Q6P9P0 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slf2Q6P9P0 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slf2Q6P9P0 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Slf2Q6P9P0 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slf2Q6P9P0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slf2Q6P9P0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Slf2Q6P9P0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slf2Q6P9P0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slf2Q6P9P0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slf2Q6P9P0 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slf2Q6P9P0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slf2Q6P9P0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slf2Q6P9P0 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slf2Q6P9P0 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slf2Q6P9P0 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slf2Q6P9P0 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Slf2Q6P9P0 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slf2Q6P9P0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slf2Q6P9P0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms