Protein–RNA interactions for Protein: Q6P6J4

Alkbh2, DNA oxidative demethylase ALKBH2, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh2Q6P6J4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Alkbh2Q6P6J4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Alkbh2Q6P6J4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alkbh2Q6P6J4 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alkbh2Q6P6J4 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alkbh2Q6P6J4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alkbh2Q6P6J4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alkbh2Q6P6J4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alkbh2Q6P6J4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alkbh2Q6P6J4 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alkbh2Q6P6J4 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alkbh2Q6P6J4 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alkbh2Q6P6J4 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alkbh2Q6P6J4 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alkbh2Q6P6J4 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alkbh2Q6P6J4 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alkbh2Q6P6J4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alkbh2Q6P6J4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alkbh2Q6P6J4 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alkbh2Q6P6J4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alkbh2Q6P6J4 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alkbh2Q6P6J4 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alkbh2Q6P6J4 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkbh2Q6P6J4 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkbh2Q6P6J4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkbh2Q6P6J4 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkbh2Q6P6J4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkbh2Q6P6J4 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkbh2Q6P6J4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkbh2Q6P6J4 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkbh2Q6P6J4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkbh2Q6P6J4 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkbh2Q6P6J4 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkbh2Q6P6J4 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkbh2Q6P6J4 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkbh2Q6P6J4 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkbh2Q6P6J4 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkbh2Q6P6J4 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkbh2Q6P6J4 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alkbh2Q6P6J4 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alkbh2Q6P6J4 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alkbh2Q6P6J4 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alkbh2Q6P6J4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alkbh2Q6P6J4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alkbh2Q6P6J4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alkbh2Q6P6J4 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alkbh2Q6P6J4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alkbh2Q6P6J4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alkbh2Q6P6J4 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alkbh2Q6P6J4 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkbh2Q6P6J4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkbh2Q6P6J4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkbh2Q6P6J4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkbh2Q6P6J4 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkbh2Q6P6J4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkbh2Q6P6J4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkbh2Q6P6J4 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkbh2Q6P6J4 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkbh2Q6P6J4 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkbh2Q6P6J4 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkbh2Q6P6J4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkbh2Q6P6J4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkbh2Q6P6J4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkbh2Q6P6J4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkbh2Q6P6J4 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkbh2Q6P6J4 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkbh2Q6P6J4 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkbh2Q6P6J4 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkbh2Q6P6J4 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkbh2Q6P6J4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkbh2Q6P6J4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkbh2Q6P6J4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkbh2Q6P6J4 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkbh2Q6P6J4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkbh2Q6P6J4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkbh2Q6P6J4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkbh2Q6P6J4 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkbh2Q6P6J4 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkbh2Q6P6J4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkbh2Q6P6J4 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkbh2Q6P6J4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkbh2Q6P6J4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkbh2Q6P6J4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkbh2Q6P6J4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkbh2Q6P6J4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkbh2Q6P6J4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkbh2Q6P6J4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkbh2Q6P6J4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkbh2Q6P6J4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkbh2Q6P6J4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkbh2Q6P6J4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkbh2Q6P6J4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkbh2Q6P6J4 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkbh2Q6P6J4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkbh2Q6P6J4 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkbh2Q6P6J4 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkbh2Q6P6J4 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Alkbh2Q6P6J4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Alkbh2Q6P6J4 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Alkbh2Q6P6J4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms