Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVG7

Colgalt2, Procollagen galactosyltransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colgalt2Q6NVG7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Colgalt2Q6NVG7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Colgalt2Q6NVG7 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Colgalt2Q6NVG7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Colgalt2Q6NVG7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Colgalt2Q6NVG7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Colgalt2Q6NVG7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Colgalt2Q6NVG7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Colgalt2Q6NVG7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Colgalt2Q6NVG7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Colgalt2Q6NVG7 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Colgalt2Q6NVG7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Colgalt2Q6NVG7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Colgalt2Q6NVG7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Colgalt2Q6NVG7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Colgalt2Q6NVG7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Colgalt2Q6NVG7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Colgalt2Q6NVG7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Colgalt2Q6NVG7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Colgalt2Q6NVG7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Colgalt2Q6NVG7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Colgalt2Q6NVG7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Colgalt2Q6NVG7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Colgalt2Q6NVG7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Colgalt2Q6NVG7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Colgalt2Q6NVG7 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Colgalt2Q6NVG7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Colgalt2Q6NVG7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Colgalt2Q6NVG7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Colgalt2Q6NVG7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Colgalt2Q6NVG7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Colgalt2Q6NVG7 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Colgalt2Q6NVG7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Colgalt2Q6NVG7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Colgalt2Q6NVG7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Colgalt2Q6NVG7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Colgalt2Q6NVG7 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Colgalt2Q6NVG7 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Colgalt2Q6NVG7 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Colgalt2Q6NVG7 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Colgalt2Q6NVG7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Colgalt2Q6NVG7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Colgalt2Q6NVG7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Colgalt2Q6NVG7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Colgalt2Q6NVG7 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Colgalt2Q6NVG7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Colgalt2Q6NVG7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Colgalt2Q6NVG7 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Colgalt2Q6NVG7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Colgalt2Q6NVG7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Colgalt2Q6NVG7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Colgalt2Q6NVG7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Colgalt2Q6NVG7 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Colgalt2Q6NVG7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Colgalt2Q6NVG7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Colgalt2Q6NVG7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Colgalt2Q6NVG7 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Colgalt2Q6NVG7 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Colgalt2Q6NVG7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Colgalt2Q6NVG7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Colgalt2Q6NVG7 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Colgalt2Q6NVG7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Colgalt2Q6NVG7 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Colgalt2Q6NVG7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Colgalt2Q6NVG7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Colgalt2Q6NVG7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Colgalt2Q6NVG7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Colgalt2Q6NVG7 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Colgalt2Q6NVG7 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Colgalt2Q6NVG7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Colgalt2Q6NVG7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Colgalt2Q6NVG7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Colgalt2Q6NVG7 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Colgalt2Q6NVG7 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Colgalt2Q6NVG7 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Colgalt2Q6NVG7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Colgalt2Q6NVG7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Colgalt2Q6NVG7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Colgalt2Q6NVG7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Colgalt2Q6NVG7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Colgalt2Q6NVG7 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Colgalt2Q6NVG7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Colgalt2Q6NVG7 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Colgalt2Q6NVG7 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Colgalt2Q6NVG7 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Colgalt2Q6NVG7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Colgalt2Q6NVG7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Colgalt2Q6NVG7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Colgalt2Q6NVG7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Colgalt2Q6NVG7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Colgalt2Q6NVG7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Colgalt2Q6NVG7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Colgalt2Q6NVG7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Colgalt2Q6NVG7 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Colgalt2Q6NVG7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Colgalt2Q6NVG7 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Colgalt2Q6NVG7 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Colgalt2Q6NVG7 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Colgalt2Q6NVG7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Colgalt2Q6NVG7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms