Protein–RNA interactions for Protein: Q6IE21

Otud6a, OTU domain-containing protein 6A, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6aQ6IE21 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Otud6aQ6IE21 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Otud6aQ6IE21 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Otud6aQ6IE21 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Otud6aQ6IE21 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Otud6aQ6IE21 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Otud6aQ6IE21 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Otud6aQ6IE21 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Otud6aQ6IE21 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Otud6aQ6IE21 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Otud6aQ6IE21 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Otud6aQ6IE21 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Otud6aQ6IE21 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Otud6aQ6IE21 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Otud6aQ6IE21 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Otud6aQ6IE21 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Otud6aQ6IE21 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Otud6aQ6IE21 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Otud6aQ6IE21 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Otud6aQ6IE21 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Otud6aQ6IE21 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Otud6aQ6IE21 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Otud6aQ6IE21 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Otud6aQ6IE21 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Otud6aQ6IE21 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Otud6aQ6IE21 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Otud6aQ6IE21 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Otud6aQ6IE21 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Otud6aQ6IE21 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Otud6aQ6IE21 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Otud6aQ6IE21 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Otud6aQ6IE21 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Otud6aQ6IE21 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Otud6aQ6IE21 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Otud6aQ6IE21 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Otud6aQ6IE21 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Otud6aQ6IE21 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Otud6aQ6IE21 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Otud6aQ6IE21 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Otud6aQ6IE21 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Otud6aQ6IE21 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Otud6aQ6IE21 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Otud6aQ6IE21 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Otud6aQ6IE21 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Otud6aQ6IE21 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Otud6aQ6IE21 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Otud6aQ6IE21 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Otud6aQ6IE21 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Otud6aQ6IE21 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Otud6aQ6IE21 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Otud6aQ6IE21 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Otud6aQ6IE21 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Otud6aQ6IE21 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Otud6aQ6IE21 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Otud6aQ6IE21 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Otud6aQ6IE21 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Otud6aQ6IE21 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Otud6aQ6IE21 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Otud6aQ6IE21 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Otud6aQ6IE21 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Otud6aQ6IE21 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Otud6aQ6IE21 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Otud6aQ6IE21 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Otud6aQ6IE21 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Otud6aQ6IE21 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Otud6aQ6IE21 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Otud6aQ6IE21 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Otud6aQ6IE21 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Otud6aQ6IE21 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Otud6aQ6IE21 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Otud6aQ6IE21 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Otud6aQ6IE21 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Otud6aQ6IE21 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Otud6aQ6IE21 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Otud6aQ6IE21 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Otud6aQ6IE21 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Otud6aQ6IE21 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Otud6aQ6IE21 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Otud6aQ6IE21 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Otud6aQ6IE21 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Otud6aQ6IE21 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Otud6aQ6IE21 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Otud6aQ6IE21 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Otud6aQ6IE21 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Otud6aQ6IE21 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Otud6aQ6IE21 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Otud6aQ6IE21 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Otud6aQ6IE21 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Otud6aQ6IE21 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Otud6aQ6IE21 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Otud6aQ6IE21 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Otud6aQ6IE21 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Otud6aQ6IE21 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Otud6aQ6IE21 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Otud6aQ6IE21 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Otud6aQ6IE21 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Otud6aQ6IE21 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Otud6aQ6IE21 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Otud6aQ6IE21 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Otud6aQ6IE21 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms