Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT1

Lrrc8e, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8eQ66JT1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrc8eQ66JT1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrc8eQ66JT1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrc8eQ66JT1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrc8eQ66JT1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrc8eQ66JT1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrc8eQ66JT1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrc8eQ66JT1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrc8eQ66JT1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrc8eQ66JT1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrc8eQ66JT1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrc8eQ66JT1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrc8eQ66JT1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrc8eQ66JT1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrc8eQ66JT1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrc8eQ66JT1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrc8eQ66JT1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrc8eQ66JT1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrc8eQ66JT1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrc8eQ66JT1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrc8eQ66JT1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrc8eQ66JT1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrc8eQ66JT1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrc8eQ66JT1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrc8eQ66JT1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lrrc8eQ66JT1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lrrc8eQ66JT1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lrrc8eQ66JT1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lrrc8eQ66JT1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lrrc8eQ66JT1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lrrc8eQ66JT1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lrrc8eQ66JT1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lrrc8eQ66JT1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lrrc8eQ66JT1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lrrc8eQ66JT1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrc8eQ66JT1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrc8eQ66JT1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrc8eQ66JT1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrc8eQ66JT1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrc8eQ66JT1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrc8eQ66JT1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrc8eQ66JT1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrc8eQ66JT1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrc8eQ66JT1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrc8eQ66JT1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrc8eQ66JT1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrc8eQ66JT1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrc8eQ66JT1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrc8eQ66JT1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrc8eQ66JT1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrc8eQ66JT1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrc8eQ66JT1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrc8eQ66JT1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrc8eQ66JT1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrc8eQ66JT1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrc8eQ66JT1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrc8eQ66JT1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrc8eQ66JT1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrc8eQ66JT1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrc8eQ66JT1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrc8eQ66JT1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrc8eQ66JT1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrc8eQ66JT1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrc8eQ66JT1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrc8eQ66JT1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrc8eQ66JT1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrc8eQ66JT1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrc8eQ66JT1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrc8eQ66JT1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrc8eQ66JT1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrc8eQ66JT1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrc8eQ66JT1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrc8eQ66JT1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrc8eQ66JT1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrc8eQ66JT1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrc8eQ66JT1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrc8eQ66JT1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrc8eQ66JT1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrc8eQ66JT1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrc8eQ66JT1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrc8eQ66JT1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrc8eQ66JT1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrc8eQ66JT1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrc8eQ66JT1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrc8eQ66JT1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrc8eQ66JT1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrc8eQ66JT1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrc8eQ66JT1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrc8eQ66JT1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrc8eQ66JT1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrc8eQ66JT1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc8eQ66JT1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc8eQ66JT1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc8eQ66JT1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc8eQ66JT1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc8eQ66JT1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc8eQ66JT1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc8eQ66JT1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc8eQ66JT1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc8eQ66JT1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms