Protein–RNA interactions for Protein: Q64213

Sf1, Splicing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf1Q64213 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sf1Q64213 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sf1Q64213 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sf1Q64213 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sf1Q64213 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sf1Q64213 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sf1Q64213 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sf1Q64213 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sf1Q64213 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sf1Q64213 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sf1Q64213 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sf1Q64213 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sf1Q64213 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sf1Q64213 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sf1Q64213 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sf1Q64213 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sf1Q64213 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sf1Q64213 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sf1Q64213 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sf1Q64213 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sf1Q64213 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sf1Q64213 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sf1Q64213 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sf1Q64213 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sf1Q64213 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sf1Q64213 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sf1Q64213 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sf1Q64213 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sf1Q64213 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sf1Q64213 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sf1Q64213 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sf1Q64213 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sf1Q64213 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sf1Q64213 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sf1Q64213 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sf1Q64213 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sf1Q64213 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sf1Q64213 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sf1Q64213 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sf1Q64213 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sf1Q64213 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sf1Q64213 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sf1Q64213 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sf1Q64213 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sf1Q64213 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sf1Q64213 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sf1Q64213 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sf1Q64213 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sf1Q64213 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sf1Q64213 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sf1Q64213 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sf1Q64213 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sf1Q64213 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sf1Q64213 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sf1Q64213 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sf1Q64213 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sf1Q64213 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sf1Q64213 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sf1Q64213 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Sf1Q64213 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf1Q64213 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf1Q64213 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf1Q64213 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf1Q64213 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf1Q64213 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf1Q64213 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf1Q64213 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf1Q64213 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf1Q64213 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf1Q64213 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf1Q64213 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf1Q64213 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf1Q64213 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf1Q64213 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf1Q64213 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf1Q64213 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf1Q64213 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf1Q64213 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf1Q64213 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf1Q64213 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf1Q64213 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf1Q64213 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf1Q64213 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf1Q64213 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf1Q64213 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf1Q64213 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sf1Q64213 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sf1Q64213 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sf1Q64213 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sf1Q64213 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sf1Q64213 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Sf1Q64213 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sf1Q64213 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sf1Q64213 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sf1Q64213 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sf1Q64213 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sf1Q64213 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf1Q64213 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf1Q64213 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf1Q64213 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms