Protein–RNA interactions for Protein: Q62443

Nptx1, Neuronal pentraxin-1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx1Q62443 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nptx1Q62443 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nptx1Q62443 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nptx1Q62443 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nptx1Q62443 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nptx1Q62443 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nptx1Q62443 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nptx1Q62443 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nptx1Q62443 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nptx1Q62443 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nptx1Q62443 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nptx1Q62443 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nptx1Q62443 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nptx1Q62443 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nptx1Q62443 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nptx1Q62443 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nptx1Q62443 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nptx1Q62443 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nptx1Q62443 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nptx1Q62443 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nptx1Q62443 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nptx1Q62443 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nptx1Q62443 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nptx1Q62443 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nptx1Q62443 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nptx1Q62443 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nptx1Q62443 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nptx1Q62443 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nptx1Q62443 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nptx1Q62443 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nptx1Q62443 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nptx1Q62443 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nptx1Q62443 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nptx1Q62443 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nptx1Q62443 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nptx1Q62443 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nptx1Q62443 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nptx1Q62443 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nptx1Q62443 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nptx1Q62443 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nptx1Q62443 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nptx1Q62443 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nptx1Q62443 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nptx1Q62443 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nptx1Q62443 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nptx1Q62443 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nptx1Q62443 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nptx1Q62443 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nptx1Q62443 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nptx1Q62443 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nptx1Q62443 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nptx1Q62443 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nptx1Q62443 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nptx1Q62443 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nptx1Q62443 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nptx1Q62443 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nptx1Q62443 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nptx1Q62443 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nptx1Q62443 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nptx1Q62443 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nptx1Q62443 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nptx1Q62443 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nptx1Q62443 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms