Protein–RNA interactions for Protein: Q62288

Spock1, Testican-1, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spock1Q62288 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Spock1Q62288 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spock1Q62288 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spock1Q62288 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spock1Q62288 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spock1Q62288 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spock1Q62288 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Spock1Q62288 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spock1Q62288 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spock1Q62288 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spock1Q62288 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spock1Q62288 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spock1Q62288 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Spock1Q62288 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spock1Q62288 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spock1Q62288 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spock1Q62288 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spock1Q62288 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spock1Q62288 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spock1Q62288 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spock1Q62288 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spock1Q62288 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spock1Q62288 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Spock1Q62288 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spock1Q62288 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms