Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sin3bQ62141 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sin3bQ62141 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sin3bQ62141 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sin3bQ62141 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sin3bQ62141 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sin3bQ62141 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sin3bQ62141 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Sin3bQ62141 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Sin3bQ62141 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sin3bQ62141 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sin3bQ62141 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sin3bQ62141 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sin3bQ62141 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sin3bQ62141 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Sin3bQ62141 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Sin3bQ62141 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sin3bQ62141 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sin3bQ62141 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sin3bQ62141 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sin3bQ62141 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sin3bQ62141 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sin3bQ62141 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sin3bQ62141 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sin3bQ62141 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sin3bQ62141 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sin3bQ62141 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sin3bQ62141 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sin3bQ62141 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sin3bQ62141 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sin3bQ62141 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sin3bQ62141 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sin3bQ62141 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sin3bQ62141 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sin3bQ62141 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sin3bQ62141 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sin3bQ62141 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sin3bQ62141 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sin3bQ62141 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sin3bQ62141 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sin3bQ62141 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sin3bQ62141 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sin3bQ62141 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sin3bQ62141 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sin3bQ62141 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sin3bQ62141 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sin3bQ62141 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sin3bQ62141 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sin3bQ62141 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sin3bQ62141 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sin3bQ62141 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sin3bQ62141 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sin3bQ62141 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sin3bQ62141 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sin3bQ62141 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sin3bQ62141 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sin3bQ62141 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sin3bQ62141 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sin3bQ62141 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Sin3bQ62141 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sin3bQ62141 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sin3bQ62141 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sin3bQ62141 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sin3bQ62141 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sin3bQ62141 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sin3bQ62141 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sin3bQ62141 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sin3bQ62141 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sin3bQ62141 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sin3bQ62141 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sin3bQ62141 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sin3bQ62141 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sin3bQ62141 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sin3bQ62141 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sin3bQ62141 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sin3bQ62141 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sin3bQ62141 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sin3bQ62141 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sin3bQ62141 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sin3bQ62141 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sin3bQ62141 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sin3bQ62141 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sin3bQ62141 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sin3bQ62141 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sin3bQ62141 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sin3bQ62141 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Sin3bQ62141 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sin3bQ62141 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sin3bQ62141 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sin3bQ62141 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sin3bQ62141 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sin3bQ62141 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sin3bQ62141 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sin3bQ62141 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sin3bQ62141 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sin3bQ62141 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Sin3bQ62141 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sin3bQ62141 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sin3bQ62141 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sin3bQ62141 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms