Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phox2aQ62066 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Phox2aQ62066 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phox2aQ62066 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phox2aQ62066 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phox2aQ62066 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phox2aQ62066 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phox2aQ62066 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phox2aQ62066 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phox2aQ62066 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phox2aQ62066 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phox2aQ62066 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phox2aQ62066 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phox2aQ62066 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Phox2aQ62066 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phox2aQ62066 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Phox2aQ62066 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phox2aQ62066 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Phox2aQ62066 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Phox2aQ62066 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phox2aQ62066 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phox2aQ62066 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phox2aQ62066 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phox2aQ62066 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phox2aQ62066 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phox2aQ62066 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phox2aQ62066 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phox2aQ62066 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phox2aQ62066 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phox2aQ62066 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phox2aQ62066 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phox2aQ62066 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phox2aQ62066 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phox2aQ62066 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phox2aQ62066 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phox2aQ62066 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phox2aQ62066 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phox2aQ62066 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phox2aQ62066 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phox2aQ62066 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phox2aQ62066 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phox2aQ62066 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phox2aQ62066 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phox2aQ62066 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phox2aQ62066 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phox2aQ62066 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phox2aQ62066 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phox2aQ62066 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phox2aQ62066 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phox2aQ62066 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phox2aQ62066 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phox2aQ62066 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phox2aQ62066 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phox2aQ62066 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phox2aQ62066 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phox2aQ62066 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phox2aQ62066 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phox2aQ62066 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phox2aQ62066 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phox2aQ62066 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phox2aQ62066 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phox2aQ62066 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phox2aQ62066 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phox2aQ62066 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phox2aQ62066 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Phox2aQ62066 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phox2aQ62066 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phox2aQ62066 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phox2aQ62066 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phox2aQ62066 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phox2aQ62066 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phox2aQ62066 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phox2aQ62066 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phox2aQ62066 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phox2aQ62066 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phox2aQ62066 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phox2aQ62066 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phox2aQ62066 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phox2aQ62066 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phox2aQ62066 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phox2aQ62066 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phox2aQ62066 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phox2aQ62066 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phox2aQ62066 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phox2aQ62066 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phox2aQ62066 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phox2aQ62066 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phox2aQ62066 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phox2aQ62066 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phox2aQ62066 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms