Protein–RNA interactions for Protein: Q61686

Cbx5, Chromobox protein homolog 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx5Q61686 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cbx5Q61686 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cbx5Q61686 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cbx5Q61686 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cbx5Q61686 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cbx5Q61686 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cbx5Q61686 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cbx5Q61686 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cbx5Q61686 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cbx5Q61686 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cbx5Q61686 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cbx5Q61686 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cbx5Q61686 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cbx5Q61686 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cbx5Q61686 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cbx5Q61686 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cbx5Q61686 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cbx5Q61686 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cbx5Q61686 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cbx5Q61686 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cbx5Q61686 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cbx5Q61686 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cbx5Q61686 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cbx5Q61686 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cbx5Q61686 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cbx5Q61686 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cbx5Q61686 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cbx5Q61686 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cbx5Q61686 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cbx5Q61686 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cbx5Q61686 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cbx5Q61686 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cbx5Q61686 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cbx5Q61686 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cbx5Q61686 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cbx5Q61686 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cbx5Q61686 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cbx5Q61686 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cbx5Q61686 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cbx5Q61686 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cbx5Q61686 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cbx5Q61686 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cbx5Q61686 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cbx5Q61686 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cbx5Q61686 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx5Q61686 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx5Q61686 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx5Q61686 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx5Q61686 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx5Q61686 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx5Q61686 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx5Q61686 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx5Q61686 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx5Q61686 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx5Q61686 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx5Q61686 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx5Q61686 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx5Q61686 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx5Q61686 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx5Q61686 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx5Q61686 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx5Q61686 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx5Q61686 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx5Q61686 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx5Q61686 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx5Q61686 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx5Q61686 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx5Q61686 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cbx5Q61686 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cbx5Q61686 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cbx5Q61686 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cbx5Q61686 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cbx5Q61686 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cbx5Q61686 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cbx5Q61686 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cbx5Q61686 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cbx5Q61686 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cbx5Q61686 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cbx5Q61686 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cbx5Q61686 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cbx5Q61686 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cbx5Q61686 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cbx5Q61686 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cbx5Q61686 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cbx5Q61686 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cbx5Q61686 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cbx5Q61686 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cbx5Q61686 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cbx5Q61686 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cbx5Q61686 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cbx5Q61686 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cbx5Q61686 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cbx5Q61686 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cbx5Q61686 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cbx5Q61686 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cbx5Q61686 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cbx5Q61686 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cbx5Q61686 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cbx5Q61686 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cbx5Q61686 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms