Protein–RNA interactions for Protein: Q61526

Erbb3, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erbb3Q61526 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Erbb3Q61526 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Erbb3Q61526 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Erbb3Q61526 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Erbb3Q61526 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Erbb3Q61526 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Erbb3Q61526 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Erbb3Q61526 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Erbb3Q61526 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Erbb3Q61526 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Erbb3Q61526 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Erbb3Q61526 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Erbb3Q61526 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Erbb3Q61526 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Erbb3Q61526 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Erbb3Q61526 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Erbb3Q61526 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Erbb3Q61526 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Erbb3Q61526 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Erbb3Q61526 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Erbb3Q61526 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Erbb3Q61526 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Erbb3Q61526 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Erbb3Q61526 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Erbb3Q61526 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Erbb3Q61526 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Erbb3Q61526 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Erbb3Q61526 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Erbb3Q61526 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Erbb3Q61526 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Erbb3Q61526 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Erbb3Q61526 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Erbb3Q61526 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Erbb3Q61526 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Erbb3Q61526 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Erbb3Q61526 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Erbb3Q61526 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Erbb3Q61526 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Erbb3Q61526 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Erbb3Q61526 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Erbb3Q61526 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Erbb3Q61526 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Erbb3Q61526 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Erbb3Q61526 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Erbb3Q61526 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Erbb3Q61526 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Erbb3Q61526 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Erbb3Q61526 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Erbb3Q61526 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Erbb3Q61526 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Erbb3Q61526 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Erbb3Q61526 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Erbb3Q61526 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Erbb3Q61526 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Erbb3Q61526 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Erbb3Q61526 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Erbb3Q61526 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Erbb3Q61526 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Erbb3Q61526 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Erbb3Q61526 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Erbb3Q61526 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Erbb3Q61526 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Erbb3Q61526 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Erbb3Q61526 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Erbb3Q61526 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Erbb3Q61526 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Erbb3Q61526 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Erbb3Q61526 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Erbb3Q61526 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Erbb3Q61526 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Erbb3Q61526 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Erbb3Q61526 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Erbb3Q61526 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Erbb3Q61526 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Erbb3Q61526 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Erbb3Q61526 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Erbb3Q61526 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Erbb3Q61526 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Erbb3Q61526 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Erbb3Q61526 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Erbb3Q61526 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Erbb3Q61526 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Erbb3Q61526 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Erbb3Q61526 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Erbb3Q61526 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Erbb3Q61526 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Erbb3Q61526 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Erbb3Q61526 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Erbb3Q61526 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Erbb3Q61526 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Erbb3Q61526 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Erbb3Q61526 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Erbb3Q61526 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Erbb3Q61526 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Erbb3Q61526 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Erbb3Q61526 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Erbb3Q61526 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Erbb3Q61526 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Erbb3Q61526 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Erbb3Q61526 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms