Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PcolceQ61398 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PcolceQ61398 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PcolceQ61398 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PcolceQ61398 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PcolceQ61398 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PcolceQ61398 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PcolceQ61398 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PcolceQ61398 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PcolceQ61398 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PcolceQ61398 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PcolceQ61398 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PcolceQ61398 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PcolceQ61398 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PcolceQ61398 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PcolceQ61398 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PcolceQ61398 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PcolceQ61398 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PcolceQ61398 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PcolceQ61398 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PcolceQ61398 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PcolceQ61398 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PcolceQ61398 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PcolceQ61398 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PcolceQ61398 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PcolceQ61398 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PcolceQ61398 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PcolceQ61398 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PcolceQ61398 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PcolceQ61398 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PcolceQ61398 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PcolceQ61398 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PcolceQ61398 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PcolceQ61398 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PcolceQ61398 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PcolceQ61398 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PcolceQ61398 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PcolceQ61398 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PcolceQ61398 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PcolceQ61398 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PcolceQ61398 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PcolceQ61398 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PcolceQ61398 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PcolceQ61398 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PcolceQ61398 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PcolceQ61398 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PcolceQ61398 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PcolceQ61398 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PcolceQ61398 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PcolceQ61398 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PcolceQ61398 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PcolceQ61398 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PcolceQ61398 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PcolceQ61398 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PcolceQ61398 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PcolceQ61398 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PcolceQ61398 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PcolceQ61398 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PcolceQ61398 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PcolceQ61398 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PcolceQ61398 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PcolceQ61398 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PcolceQ61398 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PcolceQ61398 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PcolceQ61398 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PcolceQ61398 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PcolceQ61398 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PcolceQ61398 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PcolceQ61398 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PcolceQ61398 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PcolceQ61398 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PcolceQ61398 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PcolceQ61398 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PcolceQ61398 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PcolceQ61398 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PcolceQ61398 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PcolceQ61398 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PcolceQ61398 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PcolceQ61398 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PcolceQ61398 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PcolceQ61398 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PcolceQ61398 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PcolceQ61398 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PcolceQ61398 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PcolceQ61398 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PcolceQ61398 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PcolceQ61398 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PcolceQ61398 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PcolceQ61398 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PcolceQ61398 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PcolceQ61398 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PcolceQ61398 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PcolceQ61398 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PcolceQ61398 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PcolceQ61398 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PcolceQ61398 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PcolceQ61398 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PcolceQ61398 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PcolceQ61398 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PcolceQ61398 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms