Protein–RNA interactions for Protein: Q61290

Cacna1e, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, mousemouse

Predictions only

Length 2,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1eQ61290 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacna1eQ61290 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacna1eQ61290 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacna1eQ61290 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacna1eQ61290 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacna1eQ61290 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacna1eQ61290 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacna1eQ61290 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacna1eQ61290 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacna1eQ61290 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacna1eQ61290 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacna1eQ61290 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacna1eQ61290 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacna1eQ61290 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacna1eQ61290 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacna1eQ61290 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacna1eQ61290 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacna1eQ61290 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacna1eQ61290 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacna1eQ61290 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacna1eQ61290 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacna1eQ61290 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacna1eQ61290 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacna1eQ61290 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacna1eQ61290 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacna1eQ61290 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacna1eQ61290 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacna1eQ61290 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacna1eQ61290 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacna1eQ61290 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacna1eQ61290 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacna1eQ61290 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacna1eQ61290 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacna1eQ61290 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacna1eQ61290 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacna1eQ61290 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacna1eQ61290 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacna1eQ61290 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacna1eQ61290 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacna1eQ61290 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacna1eQ61290 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacna1eQ61290 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacna1eQ61290 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacna1eQ61290 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacna1eQ61290 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacna1eQ61290 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacna1eQ61290 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacna1eQ61290 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacna1eQ61290 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacna1eQ61290 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacna1eQ61290 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacna1eQ61290 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacna1eQ61290 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacna1eQ61290 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacna1eQ61290 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacna1eQ61290 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacna1eQ61290 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacna1eQ61290 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacna1eQ61290 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacna1eQ61290 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacna1eQ61290 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacna1eQ61290 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacna1eQ61290 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacna1eQ61290 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacna1eQ61290 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacna1eQ61290 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacna1eQ61290 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacna1eQ61290 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacna1eQ61290 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacna1eQ61290 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacna1eQ61290 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacna1eQ61290 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacna1eQ61290 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacna1eQ61290 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacna1eQ61290 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacna1eQ61290 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacna1eQ61290 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacna1eQ61290 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacna1eQ61290 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacna1eQ61290 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacna1eQ61290 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacna1eQ61290 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacna1eQ61290 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacna1eQ61290 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacna1eQ61290 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacna1eQ61290 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacna1eQ61290 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacna1eQ61290 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacna1eQ61290 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacna1eQ61290 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacna1eQ61290 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacna1eQ61290 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacna1eQ61290 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacna1eQ61290 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacna1eQ61290 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacna1eQ61290 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacna1eQ61290 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacna1eQ61290 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacna1eQ61290 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacna1eQ61290 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms