Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbbp7Q60973 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbbp7Q60973 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbbp7Q60973 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbbp7Q60973 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbbp7Q60973 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbbp7Q60973 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbbp7Q60973 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbbp7Q60973 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbbp7Q60973 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbbp7Q60973 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbbp7Q60973 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbbp7Q60973 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbbp7Q60973 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbbp7Q60973 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbbp7Q60973 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbbp7Q60973 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbbp7Q60973 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbbp7Q60973 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbbp7Q60973 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbbp7Q60973 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbbp7Q60973 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbbp7Q60973 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbbp7Q60973 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbbp7Q60973 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbbp7Q60973 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbbp7Q60973 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbbp7Q60973 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbbp7Q60973 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbbp7Q60973 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbbp7Q60973 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbbp7Q60973 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbbp7Q60973 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbbp7Q60973 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbbp7Q60973 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbbp7Q60973 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbbp7Q60973 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbbp7Q60973 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbbp7Q60973 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbbp7Q60973 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbbp7Q60973 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbbp7Q60973 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbbp7Q60973 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbbp7Q60973 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbbp7Q60973 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbbp7Q60973 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbbp7Q60973 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbbp7Q60973 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbbp7Q60973 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbbp7Q60973 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbbp7Q60973 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbbp7Q60973 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbbp7Q60973 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbbp7Q60973 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbbp7Q60973 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbbp7Q60973 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbbp7Q60973 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rbbp7Q60973 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rbbp7Q60973 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbbp7Q60973 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbbp7Q60973 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbbp7Q60973 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbbp7Q60973 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbbp7Q60973 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbbp7Q60973 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbbp7Q60973 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbbp7Q60973 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbbp7Q60973 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbbp7Q60973 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbbp7Q60973 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbbp7Q60973 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbbp7Q60973 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbbp7Q60973 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbbp7Q60973 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbbp7Q60973 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbbp7Q60973 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbbp7Q60973 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbbp7Q60973 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbbp7Q60973 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbbp7Q60973 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbbp7Q60973 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbbp7Q60973 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbbp7Q60973 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbbp7Q60973 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbbp7Q60973 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbbp7Q60973 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbbp7Q60973 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbbp7Q60973 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbbp7Q60973 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbbp7Q60973 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbbp7Q60973 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbbp7Q60973 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbbp7Q60973 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbbp7Q60973 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbbp7Q60973 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbbp7Q60973 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbbp7Q60973 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbbp7Q60973 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbbp7Q60973 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbbp7Q60973 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms