Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Foxd4Q60688 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Foxd4Q60688 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Foxd4Q60688 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Foxd4Q60688 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Foxd4Q60688 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Foxd4Q60688 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Foxd4Q60688 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Foxd4Q60688 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Foxd4Q60688 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Foxd4Q60688 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Foxd4Q60688 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Foxd4Q60688 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Foxd4Q60688 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Foxd4Q60688 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Foxd4Q60688 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Foxd4Q60688 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Foxd4Q60688 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Foxd4Q60688 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Foxd4Q60688 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Foxd4Q60688 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Foxd4Q60688 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Foxd4Q60688 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Foxd4Q60688 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Foxd4Q60688 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Foxd4Q60688 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Foxd4Q60688 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Foxd4Q60688 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Foxd4Q60688 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Foxd4Q60688 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Foxd4Q60688 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Foxd4Q60688 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Foxd4Q60688 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Foxd4Q60688 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Foxd4Q60688 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Foxd4Q60688 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Foxd4Q60688 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Foxd4Q60688 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Foxd4Q60688 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Foxd4Q60688 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Foxd4Q60688 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Foxd4Q60688 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Foxd4Q60688 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Foxd4Q60688 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Foxd4Q60688 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Foxd4Q60688 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Foxd4Q60688 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Foxd4Q60688 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Foxd4Q60688 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Foxd4Q60688 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Foxd4Q60688 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Foxd4Q60688 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Foxd4Q60688 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Foxd4Q60688 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Foxd4Q60688 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Foxd4Q60688 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Foxd4Q60688 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Foxd4Q60688 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Foxd4Q60688 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Foxd4Q60688 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Foxd4Q60688 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Foxd4Q60688 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Foxd4Q60688 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Foxd4Q60688 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Foxd4Q60688 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Foxd4Q60688 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Foxd4Q60688 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Foxd4Q60688 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Foxd4Q60688 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Foxd4Q60688 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Foxd4Q60688 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Foxd4Q60688 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Foxd4Q60688 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Foxd4Q60688 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Foxd4Q60688 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Foxd4Q60688 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Foxd4Q60688 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Foxd4Q60688 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Foxd4Q60688 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Foxd4Q60688 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Foxd4Q60688 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Foxd4Q60688 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Foxd4Q60688 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Foxd4Q60688 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Foxd4Q60688 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Foxd4Q60688 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Foxd4Q60688 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Foxd4Q60688 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Foxd4Q60688 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Foxd4Q60688 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Foxd4Q60688 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Foxd4Q60688 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Foxd4Q60688 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Foxd4Q60688 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Foxd4Q60688 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Foxd4Q60688 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Foxd4Q60688 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Foxd4Q60688 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Foxd4Q60688 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Foxd4Q60688 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms