Protein–RNA interactions for Protein: Q60677

Itgae, Integrin alpha-E, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgaeQ60677 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ItgaeQ60677 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ItgaeQ60677 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ItgaeQ60677 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ItgaeQ60677 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ItgaeQ60677 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ItgaeQ60677 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ItgaeQ60677 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ItgaeQ60677 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ItgaeQ60677 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ItgaeQ60677 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ItgaeQ60677 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ItgaeQ60677 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ItgaeQ60677 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ItgaeQ60677 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ItgaeQ60677 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ItgaeQ60677 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ItgaeQ60677 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ItgaeQ60677 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ItgaeQ60677 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ItgaeQ60677 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ItgaeQ60677 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ItgaeQ60677 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ItgaeQ60677 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ItgaeQ60677 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ItgaeQ60677 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ItgaeQ60677 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ItgaeQ60677 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ItgaeQ60677 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ItgaeQ60677 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ItgaeQ60677 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ItgaeQ60677 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ItgaeQ60677 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ItgaeQ60677 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ItgaeQ60677 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ItgaeQ60677 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ItgaeQ60677 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ItgaeQ60677 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ItgaeQ60677 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ItgaeQ60677 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ItgaeQ60677 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ItgaeQ60677 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ItgaeQ60677 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ItgaeQ60677 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ItgaeQ60677 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ItgaeQ60677 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ItgaeQ60677 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ItgaeQ60677 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ItgaeQ60677 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ItgaeQ60677 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ItgaeQ60677 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ItgaeQ60677 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ItgaeQ60677 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ItgaeQ60677 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ItgaeQ60677 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ItgaeQ60677 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ItgaeQ60677 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ItgaeQ60677 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ItgaeQ60677 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ItgaeQ60677 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ItgaeQ60677 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ItgaeQ60677 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ItgaeQ60677 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ItgaeQ60677 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ItgaeQ60677 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ItgaeQ60677 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ItgaeQ60677 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ItgaeQ60677 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ItgaeQ60677 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ItgaeQ60677 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ItgaeQ60677 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ItgaeQ60677 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ItgaeQ60677 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ItgaeQ60677 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ItgaeQ60677 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ItgaeQ60677 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ItgaeQ60677 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ItgaeQ60677 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ItgaeQ60677 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ItgaeQ60677 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ItgaeQ60677 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ItgaeQ60677 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ItgaeQ60677 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ItgaeQ60677 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ItgaeQ60677 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ItgaeQ60677 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ItgaeQ60677 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ItgaeQ60677 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ItgaeQ60677 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ItgaeQ60677 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ItgaeQ60677 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ItgaeQ60677 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ItgaeQ60677 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ItgaeQ60677 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ItgaeQ60677 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ItgaeQ60677 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ItgaeQ60677 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ItgaeQ60677 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ItgaeQ60677 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ItgaeQ60677 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms