Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CttnQ60598 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CttnQ60598 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CttnQ60598 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CttnQ60598 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CttnQ60598 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CttnQ60598 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CttnQ60598 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CttnQ60598 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CttnQ60598 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CttnQ60598 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CttnQ60598 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CttnQ60598 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CttnQ60598 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CttnQ60598 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CttnQ60598 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CttnQ60598 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CttnQ60598 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CttnQ60598 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CttnQ60598 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CttnQ60598 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CttnQ60598 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CttnQ60598 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CttnQ60598 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CttnQ60598 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CttnQ60598 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CttnQ60598 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CttnQ60598 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CttnQ60598 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CttnQ60598 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CttnQ60598 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CttnQ60598 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CttnQ60598 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CttnQ60598 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CttnQ60598 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CttnQ60598 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CttnQ60598 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CttnQ60598 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CttnQ60598 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CttnQ60598 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CttnQ60598 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CttnQ60598 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CttnQ60598 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CttnQ60598 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CttnQ60598 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CttnQ60598 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CttnQ60598 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CttnQ60598 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CttnQ60598 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CttnQ60598 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CttnQ60598 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CttnQ60598 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CttnQ60598 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CttnQ60598 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CttnQ60598 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CttnQ60598 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CttnQ60598 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CttnQ60598 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CttnQ60598 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CttnQ60598 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CttnQ60598 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CttnQ60598 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CttnQ60598 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CttnQ60598 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CttnQ60598 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CttnQ60598 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CttnQ60598 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CttnQ60598 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CttnQ60598 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CttnQ60598 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CttnQ60598 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CttnQ60598 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CttnQ60598 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CttnQ60598 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CttnQ60598 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CttnQ60598 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CttnQ60598 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CttnQ60598 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CttnQ60598 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CttnQ60598 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CttnQ60598 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CttnQ60598 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CttnQ60598 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CttnQ60598 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CttnQ60598 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CttnQ60598 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CttnQ60598 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CttnQ60598 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CttnQ60598 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CttnQ60598 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CttnQ60598 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CttnQ60598 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CttnQ60598 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CttnQ60598 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CttnQ60598 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CttnQ60598 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CttnQ60598 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CttnQ60598 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CttnQ60598 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CttnQ60598 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms