Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r196Q5SVD5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r196Q5SVD5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r196Q5SVD5 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r196Q5SVD5 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r196Q5SVD5 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r196Q5SVD5 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r196Q5SVD5 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r196Q5SVD5 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r196Q5SVD5 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r196Q5SVD5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r196Q5SVD5 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r196Q5SVD5 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r196Q5SVD5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r196Q5SVD5 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r196Q5SVD5 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r196Q5SVD5 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r196Q5SVD5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r196Q5SVD5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r196Q5SVD5 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r196Q5SVD5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r196Q5SVD5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r196Q5SVD5 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r196Q5SVD5 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r196Q5SVD5 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r196Q5SVD5 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r196Q5SVD5 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r196Q5SVD5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r196Q5SVD5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r196Q5SVD5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r196Q5SVD5 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r196Q5SVD5 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r196Q5SVD5 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r196Q5SVD5 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r196Q5SVD5 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r196Q5SVD5 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r196Q5SVD5 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r196Q5SVD5 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r196Q5SVD5 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r196Q5SVD5 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r196Q5SVD5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r196Q5SVD5 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r196Q5SVD5 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r196Q5SVD5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r196Q5SVD5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r196Q5SVD5 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r196Q5SVD5 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r196Q5SVD5 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r196Q5SVD5 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r196Q5SVD5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r196Q5SVD5 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r196Q5SVD5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r196Q5SVD5 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r196Q5SVD5 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r196Q5SVD5 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r196Q5SVD5 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r196Q5SVD5 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r196Q5SVD5 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r196Q5SVD5 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r196Q5SVD5 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r196Q5SVD5 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r196Q5SVD5 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r196Q5SVD5 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r196Q5SVD5 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r196Q5SVD5 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r196Q5SVD5 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r196Q5SVD5 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r196Q5SVD5 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r196Q5SVD5 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r196Q5SVD5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r196Q5SVD5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r196Q5SVD5 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r196Q5SVD5 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r196Q5SVD5 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r196Q5SVD5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r196Q5SVD5 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r196Q5SVD5 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r196Q5SVD5 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r196Q5SVD5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r196Q5SVD5 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Vmn1r196Q5SVD5 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r196Q5SVD5 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r196Q5SVD5 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r196Q5SVD5 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r196Q5SVD5 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r196Q5SVD5 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r196Q5SVD5 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r196Q5SVD5 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r196Q5SVD5 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r196Q5SVD5 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r196Q5SVD5 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r196Q5SVD5 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r196Q5SVD5 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r196Q5SVD5 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r196Q5SVD5 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r196Q5SVD5 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms