Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSA0

Vmn1r223, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r223Q5SSA0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r223Q5SSA0 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r223Q5SSA0 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r223Q5SSA0 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r223Q5SSA0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r223Q5SSA0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r223Q5SSA0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r223Q5SSA0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r223Q5SSA0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r223Q5SSA0 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r223Q5SSA0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r223Q5SSA0 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r223Q5SSA0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r223Q5SSA0 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r223Q5SSA0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r223Q5SSA0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r223Q5SSA0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r223Q5SSA0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r223Q5SSA0 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r223Q5SSA0 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r223Q5SSA0 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r223Q5SSA0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r223Q5SSA0 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r223Q5SSA0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r223Q5SSA0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r223Q5SSA0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r223Q5SSA0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r223Q5SSA0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r223Q5SSA0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r223Q5SSA0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r223Q5SSA0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r223Q5SSA0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r223Q5SSA0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r223Q5SSA0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r223Q5SSA0 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r223Q5SSA0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r223Q5SSA0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms