Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP45

5730522E02Rik, RIKEN cDNA 5730522E02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5730522E02RikQ5SP45 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
5730522E02RikQ5SP45 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
5730522E02RikQ5SP45 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
5730522E02RikQ5SP45 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
5730522E02RikQ5SP45 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
5730522E02RikQ5SP45 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
5730522E02RikQ5SP45 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
5730522E02RikQ5SP45 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
5730522E02RikQ5SP45 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
5730522E02RikQ5SP45 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
5730522E02RikQ5SP45 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
5730522E02RikQ5SP45 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
5730522E02RikQ5SP45 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
5730522E02RikQ5SP45 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
5730522E02RikQ5SP45 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
5730522E02RikQ5SP45 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
5730522E02RikQ5SP45 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
5730522E02RikQ5SP45 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
5730522E02RikQ5SP45 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
5730522E02RikQ5SP45 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
5730522E02RikQ5SP45 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
5730522E02RikQ5SP45 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
5730522E02RikQ5SP45 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
5730522E02RikQ5SP45 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
5730522E02RikQ5SP45 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
5730522E02RikQ5SP45 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
5730522E02RikQ5SP45 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
5730522E02RikQ5SP45 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
5730522E02RikQ5SP45 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
5730522E02RikQ5SP45 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
5730522E02RikQ5SP45 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
5730522E02RikQ5SP45 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
5730522E02RikQ5SP45 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
5730522E02RikQ5SP45 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
5730522E02RikQ5SP45 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
5730522E02RikQ5SP45 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
5730522E02RikQ5SP45 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
5730522E02RikQ5SP45 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
5730522E02RikQ5SP45 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
5730522E02RikQ5SP45 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
5730522E02RikQ5SP45 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
5730522E02RikQ5SP45 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
5730522E02RikQ5SP45 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
5730522E02RikQ5SP45 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
5730522E02RikQ5SP45 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
5730522E02RikQ5SP45 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
5730522E02RikQ5SP45 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
5730522E02RikQ5SP45 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
5730522E02RikQ5SP45 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
5730522E02RikQ5SP45 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
5730522E02RikQ5SP45 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
5730522E02RikQ5SP45 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
5730522E02RikQ5SP45 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
5730522E02RikQ5SP45 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
5730522E02RikQ5SP45 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
5730522E02RikQ5SP45 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
5730522E02RikQ5SP45 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
5730522E02RikQ5SP45 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
5730522E02RikQ5SP45 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
5730522E02RikQ5SP45 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
5730522E02RikQ5SP45 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
5730522E02RikQ5SP45 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
5730522E02RikQ5SP45 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
5730522E02RikQ5SP45 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
5730522E02RikQ5SP45 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
5730522E02RikQ5SP45 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
5730522E02RikQ5SP45 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
5730522E02RikQ5SP45 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
5730522E02RikQ5SP45 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
5730522E02RikQ5SP45 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
5730522E02RikQ5SP45 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
5730522E02RikQ5SP45 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
5730522E02RikQ5SP45 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
5730522E02RikQ5SP45 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
5730522E02RikQ5SP45 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
5730522E02RikQ5SP45 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
5730522E02RikQ5SP45 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
5730522E02RikQ5SP45 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
5730522E02RikQ5SP45 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
5730522E02RikQ5SP45 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
5730522E02RikQ5SP45 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
5730522E02RikQ5SP45 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
5730522E02RikQ5SP45 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
5730522E02RikQ5SP45 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
5730522E02RikQ5SP45 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
5730522E02RikQ5SP45 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
5730522E02RikQ5SP45 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
5730522E02RikQ5SP45 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
5730522E02RikQ5SP45 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
5730522E02RikQ5SP45 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
5730522E02RikQ5SP45 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
5730522E02RikQ5SP45 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
5730522E02RikQ5SP45 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
5730522E02RikQ5SP45 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
5730522E02RikQ5SP45 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
5730522E02RikQ5SP45 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
5730522E02RikQ5SP45 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
5730522E02RikQ5SP45 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
5730522E02RikQ5SP45 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
5730522E02RikQ5SP45 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms