Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1I4

Trav6-2, T cell receptor alpha variable 6-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav6-2Q5R1I4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trav6-2Q5R1I4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trav6-2Q5R1I4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trav6-2Q5R1I4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trav6-2Q5R1I4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trav6-2Q5R1I4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trav6-2Q5R1I4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trav6-2Q5R1I4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trav6-2Q5R1I4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trav6-2Q5R1I4 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trav6-2Q5R1I4 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trav6-2Q5R1I4 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trav6-2Q5R1I4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trav6-2Q5R1I4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trav6-2Q5R1I4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trav6-2Q5R1I4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trav6-2Q5R1I4 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trav6-2Q5R1I4 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trav6-2Q5R1I4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trav6-2Q5R1I4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trav6-2Q5R1I4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trav6-2Q5R1I4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trav6-2Q5R1I4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trav6-2Q5R1I4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trav6-2Q5R1I4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trav6-2Q5R1I4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trav6-2Q5R1I4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trav6-2Q5R1I4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trav6-2Q5R1I4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trav6-2Q5R1I4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trav6-2Q5R1I4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trav6-2Q5R1I4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trav6-2Q5R1I4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trav6-2Q5R1I4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trav6-2Q5R1I4 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trav6-2Q5R1I4 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trav6-2Q5R1I4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trav6-2Q5R1I4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trav6-2Q5R1I4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trav6-2Q5R1I4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trav6-2Q5R1I4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trav6-2Q5R1I4 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trav6-2Q5R1I4 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trav6-2Q5R1I4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trav6-2Q5R1I4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trav6-2Q5R1I4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trav6-2Q5R1I4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trav6-2Q5R1I4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trav6-2Q5R1I4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trav6-2Q5R1I4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trav6-2Q5R1I4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trav6-2Q5R1I4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trav6-2Q5R1I4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trav6-2Q5R1I4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trav6-2Q5R1I4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trav6-2Q5R1I4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trav6-2Q5R1I4 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Trav6-2Q5R1I4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trav6-2Q5R1I4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Trav6-2Q5R1I4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trav6-2Q5R1I4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trav6-2Q5R1I4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trav6-2Q5R1I4 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trav6-2Q5R1I4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trav6-2Q5R1I4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trav6-2Q5R1I4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trav6-2Q5R1I4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trav6-2Q5R1I4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trav6-2Q5R1I4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trav6-2Q5R1I4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trav6-2Q5R1I4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trav6-2Q5R1I4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trav6-2Q5R1I4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trav6-2Q5R1I4 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trav6-2Q5R1I4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trav6-2Q5R1I4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Trav6-2Q5R1I4 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trav6-2Q5R1I4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trav6-2Q5R1I4 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trav6-2Q5R1I4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trav6-2Q5R1I4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trav6-2Q5R1I4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trav6-2Q5R1I4 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trav6-2Q5R1I4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trav6-2Q5R1I4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trav6-2Q5R1I4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trav6-2Q5R1I4 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trav6-2Q5R1I4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trav6-2Q5R1I4 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trav6-2Q5R1I4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trav6-2Q5R1I4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trav6-2Q5R1I4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trav6-2Q5R1I4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trav6-2Q5R1I4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trav6-2Q5R1I4 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trav6-2Q5R1I4 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trav6-2Q5R1I4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trav6-2Q5R1I4 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trav6-2Q5R1I4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trav6-2Q5R1I4 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms