Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC48

Gm12253, Predicted gene 12253, mousemouse

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm12253Q5NC48 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm12253Q5NC48 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm12253Q5NC48 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm12253Q5NC48 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm12253Q5NC48 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm12253Q5NC48 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm12253Q5NC48 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm12253Q5NC48 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm12253Q5NC48 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm12253Q5NC48 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm12253Q5NC48 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm12253Q5NC48 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm12253Q5NC48 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm12253Q5NC48 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm12253Q5NC48 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm12253Q5NC48 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm12253Q5NC48 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm12253Q5NC48 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm12253Q5NC48 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm12253Q5NC48 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm12253Q5NC48 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm12253Q5NC48 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm12253Q5NC48 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm12253Q5NC48 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm12253Q5NC48 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm12253Q5NC48 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm12253Q5NC48 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm12253Q5NC48 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm12253Q5NC48 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm12253Q5NC48 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm12253Q5NC48 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm12253Q5NC48 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm12253Q5NC48 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm12253Q5NC48 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm12253Q5NC48 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm12253Q5NC48 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm12253Q5NC48 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm12253Q5NC48 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm12253Q5NC48 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm12253Q5NC48 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm12253Q5NC48 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm12253Q5NC48 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm12253Q5NC48 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm12253Q5NC48 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm12253Q5NC48 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm12253Q5NC48 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm12253Q5NC48 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm12253Q5NC48 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm12253Q5NC48 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm12253Q5NC48 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm12253Q5NC48 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Gm12253Q5NC48 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm12253Q5NC48 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm12253Q5NC48 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm12253Q5NC48 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm12253Q5NC48 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm12253Q5NC48 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm12253Q5NC48 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm12253Q5NC48 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm12253Q5NC48 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Gm12253Q5NC48 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm12253Q5NC48 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Gm12253Q5NC48 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm12253Q5NC48 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm12253Q5NC48 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm12253Q5NC48 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm12253Q5NC48 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm12253Q5NC48 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm12253Q5NC48 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm12253Q5NC48 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm12253Q5NC48 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Gm12253Q5NC48 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm12253Q5NC48 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm12253Q5NC48 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm12253Q5NC48 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm12253Q5NC48 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm12253Q5NC48 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm12253Q5NC48 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm12253Q5NC48 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm12253Q5NC48 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm12253Q5NC48 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm12253Q5NC48 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm12253Q5NC48 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm12253Q5NC48 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm12253Q5NC48 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm12253Q5NC48 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm12253Q5NC48 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm12253Q5NC48 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm12253Q5NC48 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm12253Q5NC48 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm12253Q5NC48 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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