Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWD4

Gm20816, Predicted gene, 20816, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20816Q5FWD4 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20816Q5FWD4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20816Q5FWD4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20816Q5FWD4 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20816Q5FWD4 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20816Q5FWD4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20816Q5FWD4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20816Q5FWD4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20816Q5FWD4 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20816Q5FWD4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20816Q5FWD4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20816Q5FWD4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20816Q5FWD4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20816Q5FWD4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20816Q5FWD4 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20816Q5FWD4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20816Q5FWD4 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20816Q5FWD4 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20816Q5FWD4 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20816Q5FWD4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20816Q5FWD4 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20816Q5FWD4 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20816Q5FWD4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20816Q5FWD4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20816Q5FWD4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20816Q5FWD4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20816Q5FWD4 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm20816Q5FWD4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20816Q5FWD4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20816Q5FWD4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm20816Q5FWD4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20816Q5FWD4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20816Q5FWD4 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20816Q5FWD4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20816Q5FWD4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20816Q5FWD4 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm20816Q5FWD4 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20816Q5FWD4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20816Q5FWD4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20816Q5FWD4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20816Q5FWD4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20816Q5FWD4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20816Q5FWD4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20816Q5FWD4 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20816Q5FWD4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20816Q5FWD4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20816Q5FWD4 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20816Q5FWD4 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20816Q5FWD4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20816Q5FWD4 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20816Q5FWD4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20816Q5FWD4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20816Q5FWD4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20816Q5FWD4 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20816Q5FWD4 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20816Q5FWD4 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20816Q5FWD4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20816Q5FWD4 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20816Q5FWD4 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20816Q5FWD4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20816Q5FWD4 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20816Q5FWD4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20816Q5FWD4 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20816Q5FWD4 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20816Q5FWD4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20816Q5FWD4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20816Q5FWD4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20816Q5FWD4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20816Q5FWD4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20816Q5FWD4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20816Q5FWD4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20816Q5FWD4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20816Q5FWD4 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20816Q5FWD4 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20816Q5FWD4 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20816Q5FWD4 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20816Q5FWD4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20816Q5FWD4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20816Q5FWD4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm20816Q5FWD4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm20816Q5FWD4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm20816Q5FWD4 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm20816Q5FWD4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm20816Q5FWD4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20816Q5FWD4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20816Q5FWD4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20816Q5FWD4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20816Q5FWD4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm20816Q5FWD4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20816Q5FWD4 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20816Q5FWD4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20816Q5FWD4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20816Q5FWD4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20816Q5FWD4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20816Q5FWD4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20816Q5FWD4 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20816Q5FWD4 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20816Q5FWD4 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20816Q5FWD4 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20816Q5FWD4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms