Protein–RNA interactions for Protein: Q5F289

Spem1, Spermatid maturation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spem1Q5F289 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spem1Q5F289 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spem1Q5F289 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spem1Q5F289 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spem1Q5F289 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spem1Q5F289 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spem1Q5F289 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spem1Q5F289 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spem1Q5F289 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spem1Q5F289 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spem1Q5F289 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spem1Q5F289 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spem1Q5F289 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spem1Q5F289 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spem1Q5F289 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spem1Q5F289 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spem1Q5F289 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spem1Q5F289 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spem1Q5F289 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spem1Q5F289 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spem1Q5F289 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Spem1Q5F289 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spem1Q5F289 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spem1Q5F289 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spem1Q5F289 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spem1Q5F289 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spem1Q5F289 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spem1Q5F289 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spem1Q5F289 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spem1Q5F289 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spem1Q5F289 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spem1Q5F289 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spem1Q5F289 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spem1Q5F289 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Spem1Q5F289 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Spem1Q5F289 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Spem1Q5F289 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Spem1Q5F289 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spem1Q5F289 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spem1Q5F289 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Spem1Q5F289 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spem1Q5F289 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spem1Q5F289 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spem1Q5F289 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Spem1Q5F289 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spem1Q5F289 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spem1Q5F289 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spem1Q5F289 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spem1Q5F289 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spem1Q5F289 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Spem1Q5F289 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spem1Q5F289 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spem1Q5F289 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spem1Q5F289 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spem1Q5F289 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Spem1Q5F289 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spem1Q5F289 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spem1Q5F289 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spem1Q5F289 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spem1Q5F289 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spem1Q5F289 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Spem1Q5F289 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Spem1Q5F289 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spem1Q5F289 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spem1Q5F289 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Spem1Q5F289 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Spem1Q5F289 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Spem1Q5F289 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spem1Q5F289 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Spem1Q5F289 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spem1Q5F289 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Spem1Q5F289 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spem1Q5F289 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Spem1Q5F289 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spem1Q5F289 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spem1Q5F289 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spem1Q5F289 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spem1Q5F289 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Spem1Q5F289 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spem1Q5F289 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spem1Q5F289 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Spem1Q5F289 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Spem1Q5F289 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Spem1Q5F289 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spem1Q5F289 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Spem1Q5F289 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spem1Q5F289 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spem1Q5F289 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spem1Q5F289 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Spem1Q5F289 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spem1Q5F289 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spem1Q5F289 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Spem1Q5F289 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spem1Q5F289 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spem1Q5F289 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spem1Q5F289 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Spem1Q5F289 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Spem1Q5F289 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Spem1Q5F289 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Spem1Q5F289 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.6 ms