Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTW2

Sfmbt2, Scm-like with four MBT domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt2Q5DTW2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sfmbt2Q5DTW2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sfmbt2Q5DTW2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sfmbt2Q5DTW2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sfmbt2Q5DTW2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sfmbt2Q5DTW2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sfmbt2Q5DTW2 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sfmbt2Q5DTW2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sfmbt2Q5DTW2 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sfmbt2Q5DTW2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sfmbt2Q5DTW2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sfmbt2Q5DTW2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sfmbt2Q5DTW2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sfmbt2Q5DTW2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sfmbt2Q5DTW2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sfmbt2Q5DTW2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sfmbt2Q5DTW2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sfmbt2Q5DTW2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sfmbt2Q5DTW2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sfmbt2Q5DTW2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sfmbt2Q5DTW2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sfmbt2Q5DTW2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sfmbt2Q5DTW2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sfmbt2Q5DTW2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sfmbt2Q5DTW2 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sfmbt2Q5DTW2 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sfmbt2Q5DTW2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sfmbt2Q5DTW2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sfmbt2Q5DTW2 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sfmbt2Q5DTW2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sfmbt2Q5DTW2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sfmbt2Q5DTW2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sfmbt2Q5DTW2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sfmbt2Q5DTW2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sfmbt2Q5DTW2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sfmbt2Q5DTW2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sfmbt2Q5DTW2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sfmbt2Q5DTW2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sfmbt2Q5DTW2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sfmbt2Q5DTW2 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sfmbt2Q5DTW2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sfmbt2Q5DTW2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sfmbt2Q5DTW2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sfmbt2Q5DTW2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sfmbt2Q5DTW2 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sfmbt2Q5DTW2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sfmbt2Q5DTW2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sfmbt2Q5DTW2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sfmbt2Q5DTW2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sfmbt2Q5DTW2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sfmbt2Q5DTW2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sfmbt2Q5DTW2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sfmbt2Q5DTW2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sfmbt2Q5DTW2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sfmbt2Q5DTW2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sfmbt2Q5DTW2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sfmbt2Q5DTW2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sfmbt2Q5DTW2 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sfmbt2Q5DTW2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sfmbt2Q5DTW2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sfmbt2Q5DTW2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sfmbt2Q5DTW2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sfmbt2Q5DTW2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sfmbt2Q5DTW2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sfmbt2Q5DTW2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sfmbt2Q5DTW2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sfmbt2Q5DTW2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sfmbt2Q5DTW2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sfmbt2Q5DTW2 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sfmbt2Q5DTW2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sfmbt2Q5DTW2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sfmbt2Q5DTW2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sfmbt2Q5DTW2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sfmbt2Q5DTW2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sfmbt2Q5DTW2 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sfmbt2Q5DTW2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sfmbt2Q5DTW2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sfmbt2Q5DTW2 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sfmbt2Q5DTW2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sfmbt2Q5DTW2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sfmbt2Q5DTW2 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Sfmbt2Q5DTW2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Sfmbt2Q5DTW2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sfmbt2Q5DTW2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sfmbt2Q5DTW2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sfmbt2Q5DTW2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sfmbt2Q5DTW2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sfmbt2Q5DTW2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sfmbt2Q5DTW2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sfmbt2Q5DTW2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sfmbt2Q5DTW2 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sfmbt2Q5DTW2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sfmbt2Q5DTW2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sfmbt2Q5DTW2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sfmbt2Q5DTW2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sfmbt2Q5DTW2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sfmbt2Q5DTW2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sfmbt2Q5DTW2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sfmbt2Q5DTW2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sfmbt2Q5DTW2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms