Protein–RNA interactions for Protein: Q59J78

Ndufaf2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf2Q59J78 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ndufaf2Q59J78 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ndufaf2Q59J78 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ndufaf2Q59J78 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ndufaf2Q59J78 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ndufaf2Q59J78 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ndufaf2Q59J78 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ndufaf2Q59J78 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ndufaf2Q59J78 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ndufaf2Q59J78 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ndufaf2Q59J78 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ndufaf2Q59J78 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ndufaf2Q59J78 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ndufaf2Q59J78 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ndufaf2Q59J78 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ndufaf2Q59J78 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ndufaf2Q59J78 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ndufaf2Q59J78 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ndufaf2Q59J78 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ndufaf2Q59J78 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ndufaf2Q59J78 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ndufaf2Q59J78 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ndufaf2Q59J78 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ndufaf2Q59J78 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ndufaf2Q59J78 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ndufaf2Q59J78 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ndufaf2Q59J78 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ndufaf2Q59J78 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ndufaf2Q59J78 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ndufaf2Q59J78 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ndufaf2Q59J78 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ndufaf2Q59J78 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ndufaf2Q59J78 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ndufaf2Q59J78 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ndufaf2Q59J78 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ndufaf2Q59J78 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ndufaf2Q59J78 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ndufaf2Q59J78 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ndufaf2Q59J78 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ndufaf2Q59J78 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ndufaf2Q59J78 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ndufaf2Q59J78 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ndufaf2Q59J78 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ndufaf2Q59J78 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ndufaf2Q59J78 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ndufaf2Q59J78 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ndufaf2Q59J78 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ndufaf2Q59J78 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ndufaf2Q59J78 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ndufaf2Q59J78 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ndufaf2Q59J78 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ndufaf2Q59J78 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ndufaf2Q59J78 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ndufaf2Q59J78 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ndufaf2Q59J78 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ndufaf2Q59J78 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ndufaf2Q59J78 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ndufaf2Q59J78 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ndufaf2Q59J78 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ndufaf2Q59J78 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ndufaf2Q59J78 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ndufaf2Q59J78 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms