Protein–RNA interactions for Protein: Q587J6

L1td1, LINE-1 type transposase domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1td1Q587J6 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
L1td1Q587J6 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
L1td1Q587J6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
L1td1Q587J6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
L1td1Q587J6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
L1td1Q587J6 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
L1td1Q587J6 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
L1td1Q587J6 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
L1td1Q587J6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
L1td1Q587J6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
L1td1Q587J6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
L1td1Q587J6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
L1td1Q587J6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
L1td1Q587J6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
L1td1Q587J6 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
L1td1Q587J6 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
L1td1Q587J6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
L1td1Q587J6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
L1td1Q587J6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
L1td1Q587J6 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
L1td1Q587J6 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
L1td1Q587J6 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
L1td1Q587J6 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
L1td1Q587J6 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
L1td1Q587J6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
L1td1Q587J6 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
L1td1Q587J6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
L1td1Q587J6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
L1td1Q587J6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
L1td1Q587J6 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
L1td1Q587J6 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
L1td1Q587J6 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
L1td1Q587J6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
L1td1Q587J6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
L1td1Q587J6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
L1td1Q587J6 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
L1td1Q587J6 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
L1td1Q587J6 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
L1td1Q587J6 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
L1td1Q587J6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
L1td1Q587J6 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
L1td1Q587J6 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
L1td1Q587J6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
L1td1Q587J6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
L1td1Q587J6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
L1td1Q587J6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
L1td1Q587J6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
L1td1Q587J6 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
L1td1Q587J6 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
L1td1Q587J6 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
L1td1Q587J6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
L1td1Q587J6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
L1td1Q587J6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
L1td1Q587J6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
L1td1Q587J6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
L1td1Q587J6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
L1td1Q587J6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
L1td1Q587J6 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
L1td1Q587J6 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
L1td1Q587J6 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
L1td1Q587J6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
L1td1Q587J6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
L1td1Q587J6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
L1td1Q587J6 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
L1td1Q587J6 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
L1td1Q587J6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
L1td1Q587J6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
L1td1Q587J6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
L1td1Q587J6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
L1td1Q587J6 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
L1td1Q587J6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
L1td1Q587J6 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
L1td1Q587J6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
L1td1Q587J6 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
L1td1Q587J6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
L1td1Q587J6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
L1td1Q587J6 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
L1td1Q587J6 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
L1td1Q587J6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
L1td1Q587J6 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
L1td1Q587J6 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
L1td1Q587J6 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
L1td1Q587J6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
L1td1Q587J6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
L1td1Q587J6 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
L1td1Q587J6 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
L1td1Q587J6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
L1td1Q587J6 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
L1td1Q587J6 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
L1td1Q587J6 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
L1td1Q587J6 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
L1td1Q587J6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
L1td1Q587J6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
L1td1Q587J6 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
L1td1Q587J6 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
L1td1Q587J6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
L1td1Q587J6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
L1td1Q587J6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
L1td1Q587J6 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
L1td1Q587J6 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms