Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJM7

Otol1, Otolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otol1Q4ZJM7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otol1Q4ZJM7 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otol1Q4ZJM7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otol1Q4ZJM7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otol1Q4ZJM7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otol1Q4ZJM7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otol1Q4ZJM7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otol1Q4ZJM7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otol1Q4ZJM7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otol1Q4ZJM7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otol1Q4ZJM7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otol1Q4ZJM7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otol1Q4ZJM7 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otol1Q4ZJM7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otol1Q4ZJM7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Otol1Q4ZJM7 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Otol1Q4ZJM7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Otol1Q4ZJM7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Otol1Q4ZJM7 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Otol1Q4ZJM7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Otol1Q4ZJM7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Otol1Q4ZJM7 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Otol1Q4ZJM7 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Otol1Q4ZJM7 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Otol1Q4ZJM7 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Otol1Q4ZJM7 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Otol1Q4ZJM7 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Otol1Q4ZJM7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Otol1Q4ZJM7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Otol1Q4ZJM7 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Otol1Q4ZJM7 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Otol1Q4ZJM7 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Otol1Q4ZJM7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Otol1Q4ZJM7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Otol1Q4ZJM7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Otol1Q4ZJM7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Otol1Q4ZJM7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Otol1Q4ZJM7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Otol1Q4ZJM7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Otol1Q4ZJM7 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Otol1Q4ZJM7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Otol1Q4ZJM7 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Otol1Q4ZJM7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Otol1Q4ZJM7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Otol1Q4ZJM7 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Otol1Q4ZJM7 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Otol1Q4ZJM7 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Otol1Q4ZJM7 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Otol1Q4ZJM7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otol1Q4ZJM7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otol1Q4ZJM7 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otol1Q4ZJM7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otol1Q4ZJM7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otol1Q4ZJM7 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otol1Q4ZJM7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otol1Q4ZJM7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otol1Q4ZJM7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otol1Q4ZJM7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otol1Q4ZJM7 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otol1Q4ZJM7 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otol1Q4ZJM7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otol1Q4ZJM7 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otol1Q4ZJM7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otol1Q4ZJM7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otol1Q4ZJM7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otol1Q4ZJM7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otol1Q4ZJM7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otol1Q4ZJM7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otol1Q4ZJM7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otol1Q4ZJM7 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otol1Q4ZJM7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otol1Q4ZJM7 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otol1Q4ZJM7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Otol1Q4ZJM7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otol1Q4ZJM7 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otol1Q4ZJM7 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otol1Q4ZJM7 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otol1Q4ZJM7 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otol1Q4ZJM7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otol1Q4ZJM7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Otol1Q4ZJM7 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otol1Q4ZJM7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otol1Q4ZJM7 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Otol1Q4ZJM7 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otol1Q4ZJM7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otol1Q4ZJM7 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otol1Q4ZJM7 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Otol1Q4ZJM7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Otol1Q4ZJM7 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otol1Q4ZJM7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otol1Q4ZJM7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Otol1Q4ZJM7 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otol1Q4ZJM7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otol1Q4ZJM7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otol1Q4ZJM7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otol1Q4ZJM7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otol1Q4ZJM7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otol1Q4ZJM7 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otol1Q4ZJM7 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otol1Q4ZJM7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms