Protein–RNA interactions for Protein: Q3V460

Smim26, Gene model 561, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim26Q3V460 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC12.33□□□□□ -0.43
Smim26Q3V460 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Smim26Q3V460 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim26Q3V460 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim26Q3V460 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim26Q3V460 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim26Q3V460 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim26Q3V460 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim26Q3V460 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim26Q3V460 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim26Q3V460 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim26Q3V460 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim26Q3V460 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim26Q3V460 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim26Q3V460 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim26Q3V460 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim26Q3V460 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim26Q3V460 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim26Q3V460 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim26Q3V460 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim26Q3V460 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim26Q3V460 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim26Q3V460 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim26Q3V460 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim26Q3V460 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim26Q3V460 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim26Q3V460 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim26Q3V460 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim26Q3V460 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim26Q3V460 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim26Q3V460 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim26Q3V460 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim26Q3V460 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim26Q3V460 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim26Q3V460 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim26Q3V460 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim26Q3V460 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim26Q3V460 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim26Q3V460 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim26Q3V460 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim26Q3V460 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim26Q3V460 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim26Q3V460 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim26Q3V460 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim26Q3V460 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim26Q3V460 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim26Q3V460 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim26Q3V460 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim26Q3V460 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim26Q3V460 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim26Q3V460 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim26Q3V460 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim26Q3V460 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim26Q3V460 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim26Q3V460 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim26Q3V460 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim26Q3V460 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim26Q3V460 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim26Q3V460 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim26Q3V460 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim26Q3V460 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim26Q3V460 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim26Q3V460 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim26Q3V460 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim26Q3V460 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim26Q3V460 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim26Q3V460 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim26Q3V460 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim26Q3V460 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim26Q3V460 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim26Q3V460 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim26Q3V460 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim26Q3V460 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim26Q3V460 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim26Q3V460 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim26Q3V460 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim26Q3V460 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim26Q3V460 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim26Q3V460 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim26Q3V460 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim26Q3V460 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim26Q3V460 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim26Q3V460 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim26Q3V460 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim26Q3V460 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim26Q3V460 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim26Q3V460 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim26Q3V460 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim26Q3V460 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim26Q3V460 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim26Q3V460 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim26Q3V460 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim26Q3V460 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim26Q3V460 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim26Q3V460 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim26Q3V460 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim26Q3V460 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim26Q3V460 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim26Q3V460 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim26Q3V460 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms