Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrrc43Q3V0L5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrrc43Q3V0L5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrrc43Q3V0L5 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrrc43Q3V0L5 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrrc43Q3V0L5 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrrc43Q3V0L5 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrrc43Q3V0L5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrrc43Q3V0L5 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrrc43Q3V0L5 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrrc43Q3V0L5 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrrc43Q3V0L5 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrrc43Q3V0L5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrrc43Q3V0L5 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrrc43Q3V0L5 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrrc43Q3V0L5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrrc43Q3V0L5 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrrc43Q3V0L5 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrrc43Q3V0L5 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrrc43Q3V0L5 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrrc43Q3V0L5 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrrc43Q3V0L5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrrc43Q3V0L5 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrrc43Q3V0L5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrrc43Q3V0L5 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrrc43Q3V0L5 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrrc43Q3V0L5 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lrrc43Q3V0L5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lrrc43Q3V0L5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lrrc43Q3V0L5 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lrrc43Q3V0L5 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lrrc43Q3V0L5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lrrc43Q3V0L5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lrrc43Q3V0L5 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lrrc43Q3V0L5 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lrrc43Q3V0L5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrrc43Q3V0L5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrrc43Q3V0L5 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrrc43Q3V0L5 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrrc43Q3V0L5 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrrc43Q3V0L5 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrrc43Q3V0L5 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrrc43Q3V0L5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrrc43Q3V0L5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrrc43Q3V0L5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrrc43Q3V0L5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrrc43Q3V0L5 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrrc43Q3V0L5 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrrc43Q3V0L5 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrrc43Q3V0L5 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrrc43Q3V0L5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrrc43Q3V0L5 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrrc43Q3V0L5 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrrc43Q3V0L5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrrc43Q3V0L5 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrrc43Q3V0L5 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrrc43Q3V0L5 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrrc43Q3V0L5 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrrc43Q3V0L5 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrrc43Q3V0L5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrrc43Q3V0L5 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrrc43Q3V0L5 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrrc43Q3V0L5 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrrc43Q3V0L5 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrrc43Q3V0L5 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrrc43Q3V0L5 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrrc43Q3V0L5 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrrc43Q3V0L5 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrrc43Q3V0L5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrrc43Q3V0L5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrrc43Q3V0L5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrrc43Q3V0L5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lrrc43Q3V0L5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lrrc43Q3V0L5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lrrc43Q3V0L5 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lrrc43Q3V0L5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lrrc43Q3V0L5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lrrc43Q3V0L5 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lrrc43Q3V0L5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lrrc43Q3V0L5 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lrrc43Q3V0L5 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Lrrc43Q3V0L5 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Lrrc43Q3V0L5 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lrrc43Q3V0L5 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lrrc43Q3V0L5 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lrrc43Q3V0L5 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lrrc43Q3V0L5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lrrc43Q3V0L5 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lrrc43Q3V0L5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lrrc43Q3V0L5 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lrrc43Q3V0L5 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lrrc43Q3V0L5 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lrrc43Q3V0L5 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrrc43Q3V0L5 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrrc43Q3V0L5 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrrc43Q3V0L5 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrrc43Q3V0L5 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrrc43Q3V0L5 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrrc43Q3V0L5 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrrc43Q3V0L5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms