Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Rnpc3Q3UZ01 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rnpc3Q3UZ01 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rnpc3Q3UZ01 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Rnpc3Q3UZ01 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rnpc3Q3UZ01 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rnpc3Q3UZ01 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rnpc3Q3UZ01 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rnpc3Q3UZ01 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rnpc3Q3UZ01 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rnpc3Q3UZ01 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Rnpc3Q3UZ01 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Rnpc3Q3UZ01 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rnpc3Q3UZ01 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rnpc3Q3UZ01 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rnpc3Q3UZ01 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rnpc3Q3UZ01 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rnpc3Q3UZ01 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnpc3Q3UZ01 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnpc3Q3UZ01 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnpc3Q3UZ01 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnpc3Q3UZ01 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnpc3Q3UZ01 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnpc3Q3UZ01 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnpc3Q3UZ01 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnpc3Q3UZ01 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnpc3Q3UZ01 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnpc3Q3UZ01 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnpc3Q3UZ01 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnpc3Q3UZ01 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnpc3Q3UZ01 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnpc3Q3UZ01 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnpc3Q3UZ01 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnpc3Q3UZ01 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnpc3Q3UZ01 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnpc3Q3UZ01 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnpc3Q3UZ01 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnpc3Q3UZ01 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnpc3Q3UZ01 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnpc3Q3UZ01 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnpc3Q3UZ01 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnpc3Q3UZ01 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnpc3Q3UZ01 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnpc3Q3UZ01 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnpc3Q3UZ01 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnpc3Q3UZ01 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnpc3Q3UZ01 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnpc3Q3UZ01 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnpc3Q3UZ01 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnpc3Q3UZ01 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnpc3Q3UZ01 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnpc3Q3UZ01 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnpc3Q3UZ01 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnpc3Q3UZ01 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnpc3Q3UZ01 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnpc3Q3UZ01 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnpc3Q3UZ01 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnpc3Q3UZ01 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnpc3Q3UZ01 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnpc3Q3UZ01 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnpc3Q3UZ01 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnpc3Q3UZ01 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnpc3Q3UZ01 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rnpc3Q3UZ01 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rnpc3Q3UZ01 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rnpc3Q3UZ01 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rnpc3Q3UZ01 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Rnpc3Q3UZ01 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rnpc3Q3UZ01 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rnpc3Q3UZ01 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rnpc3Q3UZ01 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rnpc3Q3UZ01 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rnpc3Q3UZ01 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rnpc3Q3UZ01 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rnpc3Q3UZ01 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rnpc3Q3UZ01 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rnpc3Q3UZ01 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rnpc3Q3UZ01 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnpc3Q3UZ01 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnpc3Q3UZ01 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnpc3Q3UZ01 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnpc3Q3UZ01 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnpc3Q3UZ01 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnpc3Q3UZ01 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnpc3Q3UZ01 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnpc3Q3UZ01 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnpc3Q3UZ01 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnpc3Q3UZ01 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnpc3Q3UZ01 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnpc3Q3UZ01 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnpc3Q3UZ01 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnpc3Q3UZ01 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnpc3Q3UZ01 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnpc3Q3UZ01 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnpc3Q3UZ01 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnpc3Q3UZ01 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnpc3Q3UZ01 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnpc3Q3UZ01 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnpc3Q3UZ01 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnpc3Q3UZ01 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms