Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc160Q3UYG1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc160Q3UYG1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc160Q3UYG1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc160Q3UYG1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc160Q3UYG1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc160Q3UYG1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc160Q3UYG1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc160Q3UYG1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc160Q3UYG1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc160Q3UYG1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc160Q3UYG1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc160Q3UYG1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc160Q3UYG1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc160Q3UYG1 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc160Q3UYG1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc160Q3UYG1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc160Q3UYG1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccdc160Q3UYG1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc160Q3UYG1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc160Q3UYG1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc160Q3UYG1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc160Q3UYG1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc160Q3UYG1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc160Q3UYG1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc160Q3UYG1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc160Q3UYG1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc160Q3UYG1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc160Q3UYG1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc160Q3UYG1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc160Q3UYG1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc160Q3UYG1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc160Q3UYG1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc160Q3UYG1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc160Q3UYG1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc160Q3UYG1 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc160Q3UYG1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc160Q3UYG1 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc160Q3UYG1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc160Q3UYG1 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc160Q3UYG1 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc160Q3UYG1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc160Q3UYG1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc160Q3UYG1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc160Q3UYG1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc160Q3UYG1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc160Q3UYG1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc160Q3UYG1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc160Q3UYG1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc160Q3UYG1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc160Q3UYG1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc160Q3UYG1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc160Q3UYG1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc160Q3UYG1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc160Q3UYG1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc160Q3UYG1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc160Q3UYG1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc160Q3UYG1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc160Q3UYG1 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc160Q3UYG1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc160Q3UYG1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc160Q3UYG1 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc160Q3UYG1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc160Q3UYG1 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc160Q3UYG1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc160Q3UYG1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc160Q3UYG1 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc160Q3UYG1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc160Q3UYG1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc160Q3UYG1 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc160Q3UYG1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc160Q3UYG1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc160Q3UYG1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc160Q3UYG1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc160Q3UYG1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc160Q3UYG1 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc160Q3UYG1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc160Q3UYG1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc160Q3UYG1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc160Q3UYG1 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc160Q3UYG1 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc160Q3UYG1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc160Q3UYG1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc160Q3UYG1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc160Q3UYG1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc160Q3UYG1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc160Q3UYG1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc160Q3UYG1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc160Q3UYG1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc160Q3UYG1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc160Q3UYG1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc160Q3UYG1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc160Q3UYG1 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc160Q3UYG1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc160Q3UYG1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc160Q3UYG1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc160Q3UYG1 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc160Q3UYG1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc160Q3UYG1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc160Q3UYG1 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms