Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV9

H2-Eb2, Histocompatibility 2, class II antigen E beta2, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb2Q3UUV9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-Eb2Q3UUV9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-Eb2Q3UUV9 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-Eb2Q3UUV9 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-Eb2Q3UUV9 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-Eb2Q3UUV9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-Eb2Q3UUV9 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-Eb2Q3UUV9 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-Eb2Q3UUV9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-Eb2Q3UUV9 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-Eb2Q3UUV9 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-Eb2Q3UUV9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-Eb2Q3UUV9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-Eb2Q3UUV9 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-Eb2Q3UUV9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-Eb2Q3UUV9 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-Eb2Q3UUV9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-Eb2Q3UUV9 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-Eb2Q3UUV9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-Eb2Q3UUV9 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-Eb2Q3UUV9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-Eb2Q3UUV9 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-Eb2Q3UUV9 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-Eb2Q3UUV9 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-Eb2Q3UUV9 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-Eb2Q3UUV9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-Eb2Q3UUV9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-Eb2Q3UUV9 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-Eb2Q3UUV9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-Eb2Q3UUV9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-Eb2Q3UUV9 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-Eb2Q3UUV9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-Eb2Q3UUV9 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-Eb2Q3UUV9 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-Eb2Q3UUV9 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-Eb2Q3UUV9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-Eb2Q3UUV9 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-Eb2Q3UUV9 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-Eb2Q3UUV9 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-Eb2Q3UUV9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-Eb2Q3UUV9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-Eb2Q3UUV9 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-Eb2Q3UUV9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-Eb2Q3UUV9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-Eb2Q3UUV9 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-Eb2Q3UUV9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-Eb2Q3UUV9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-Eb2Q3UUV9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-Eb2Q3UUV9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-Eb2Q3UUV9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-Eb2Q3UUV9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-Eb2Q3UUV9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-Eb2Q3UUV9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-Eb2Q3UUV9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-Eb2Q3UUV9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-Eb2Q3UUV9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-Eb2Q3UUV9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-Eb2Q3UUV9 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-Eb2Q3UUV9 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-Eb2Q3UUV9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-Eb2Q3UUV9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-Eb2Q3UUV9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-Eb2Q3UUV9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-Eb2Q3UUV9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-Eb2Q3UUV9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-Eb2Q3UUV9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-Eb2Q3UUV9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-Eb2Q3UUV9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-Eb2Q3UUV9 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-Eb2Q3UUV9 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-Eb2Q3UUV9 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-Eb2Q3UUV9 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-Eb2Q3UUV9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-Eb2Q3UUV9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-Eb2Q3UUV9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-Eb2Q3UUV9 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-Eb2Q3UUV9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-Eb2Q3UUV9 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-Eb2Q3UUV9 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-Eb2Q3UUV9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-Eb2Q3UUV9 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-Eb2Q3UUV9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-Eb2Q3UUV9 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-Eb2Q3UUV9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-Eb2Q3UUV9 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-Eb2Q3UUV9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-Eb2Q3UUV9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-Eb2Q3UUV9 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-Eb2Q3UUV9 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-Eb2Q3UUV9 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-Eb2Q3UUV9 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-Eb2Q3UUV9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-Eb2Q3UUV9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-Eb2Q3UUV9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-Eb2Q3UUV9 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-Eb2Q3UUV9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-Eb2Q3UUV9 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
H2-Eb2Q3UUV9 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-Eb2Q3UUV9 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-Eb2Q3UUV9 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms