Protein–RNA interactions for Protein: Q3URK1

Ccdc190, Coiled-coil domain-containing protein 190, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc190Q3URK1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc190Q3URK1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc190Q3URK1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc190Q3URK1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc190Q3URK1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc190Q3URK1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc190Q3URK1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc190Q3URK1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc190Q3URK1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc190Q3URK1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc190Q3URK1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc190Q3URK1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc190Q3URK1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc190Q3URK1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc190Q3URK1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc190Q3URK1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc190Q3URK1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc190Q3URK1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc190Q3URK1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc190Q3URK1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc190Q3URK1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc190Q3URK1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc190Q3URK1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc190Q3URK1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc190Q3URK1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc190Q3URK1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc190Q3URK1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc190Q3URK1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc190Q3URK1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc190Q3URK1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc190Q3URK1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc190Q3URK1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc190Q3URK1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc190Q3URK1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc190Q3URK1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc190Q3URK1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc190Q3URK1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc190Q3URK1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc190Q3URK1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc190Q3URK1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc190Q3URK1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc190Q3URK1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc190Q3URK1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc190Q3URK1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc190Q3URK1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc190Q3URK1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc190Q3URK1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc190Q3URK1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc190Q3URK1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc190Q3URK1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc190Q3URK1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc190Q3URK1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc190Q3URK1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc190Q3URK1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc190Q3URK1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc190Q3URK1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc190Q3URK1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc190Q3URK1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc190Q3URK1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc190Q3URK1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc190Q3URK1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc190Q3URK1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc190Q3URK1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc190Q3URK1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc190Q3URK1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc190Q3URK1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc190Q3URK1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc190Q3URK1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc190Q3URK1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc190Q3URK1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc190Q3URK1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc190Q3URK1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc190Q3URK1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc190Q3URK1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc190Q3URK1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc190Q3URK1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc190Q3URK1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc190Q3URK1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc190Q3URK1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc190Q3URK1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc190Q3URK1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc190Q3URK1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc190Q3URK1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc190Q3URK1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc190Q3URK1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc190Q3URK1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc190Q3URK1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc190Q3URK1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc190Q3URK1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc190Q3URK1 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc190Q3URK1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc190Q3URK1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc190Q3URK1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc190Q3URK1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc190Q3URK1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc190Q3URK1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc190Q3URK1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc190Q3URK1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc190Q3URK1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc190Q3URK1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms