Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMB9

Washc4, WASH complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Washc4Q3UMB9 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Washc4Q3UMB9 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Washc4Q3UMB9 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Washc4Q3UMB9 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Washc4Q3UMB9 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Washc4Q3UMB9 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Washc4Q3UMB9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Washc4Q3UMB9 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Washc4Q3UMB9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Washc4Q3UMB9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Washc4Q3UMB9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Washc4Q3UMB9 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Washc4Q3UMB9 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Washc4Q3UMB9 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Washc4Q3UMB9 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Washc4Q3UMB9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Washc4Q3UMB9 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Washc4Q3UMB9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Washc4Q3UMB9 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Washc4Q3UMB9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Washc4Q3UMB9 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Washc4Q3UMB9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Washc4Q3UMB9 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Washc4Q3UMB9 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Washc4Q3UMB9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Washc4Q3UMB9 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Washc4Q3UMB9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Washc4Q3UMB9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Washc4Q3UMB9 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Washc4Q3UMB9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Washc4Q3UMB9 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Washc4Q3UMB9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Washc4Q3UMB9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Washc4Q3UMB9 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Washc4Q3UMB9 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Washc4Q3UMB9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Washc4Q3UMB9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Washc4Q3UMB9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Washc4Q3UMB9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Washc4Q3UMB9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Washc4Q3UMB9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Washc4Q3UMB9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Washc4Q3UMB9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Washc4Q3UMB9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Washc4Q3UMB9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Washc4Q3UMB9 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Washc4Q3UMB9 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Washc4Q3UMB9 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Washc4Q3UMB9 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Washc4Q3UMB9 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Washc4Q3UMB9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Washc4Q3UMB9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Washc4Q3UMB9 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Washc4Q3UMB9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Washc4Q3UMB9 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Washc4Q3UMB9 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Washc4Q3UMB9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Washc4Q3UMB9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Washc4Q3UMB9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Washc4Q3UMB9 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Washc4Q3UMB9 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Washc4Q3UMB9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Washc4Q3UMB9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Washc4Q3UMB9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Washc4Q3UMB9 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Washc4Q3UMB9 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Washc4Q3UMB9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Washc4Q3UMB9 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Washc4Q3UMB9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Washc4Q3UMB9 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Washc4Q3UMB9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Washc4Q3UMB9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Washc4Q3UMB9 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Washc4Q3UMB9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Washc4Q3UMB9 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Washc4Q3UMB9 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Washc4Q3UMB9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Washc4Q3UMB9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Washc4Q3UMB9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Washc4Q3UMB9 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Washc4Q3UMB9 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Washc4Q3UMB9 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Washc4Q3UMB9 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Washc4Q3UMB9 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Washc4Q3UMB9 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Washc4Q3UMB9 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Washc4Q3UMB9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Washc4Q3UMB9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Washc4Q3UMB9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Washc4Q3UMB9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Washc4Q3UMB9 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Washc4Q3UMB9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Washc4Q3UMB9 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Washc4Q3UMB9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Washc4Q3UMB9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Washc4Q3UMB9 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Washc4Q3UMB9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Washc4Q3UMB9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Washc4Q3UMB9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Washc4Q3UMB9 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms