Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBG2

Pid1, PTB-containing, cubilin and LRP1-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pid1Q3UBG2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pid1Q3UBG2 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pid1Q3UBG2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pid1Q3UBG2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pid1Q3UBG2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pid1Q3UBG2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pid1Q3UBG2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pid1Q3UBG2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pid1Q3UBG2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Pid1Q3UBG2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pid1Q3UBG2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pid1Q3UBG2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pid1Q3UBG2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pid1Q3UBG2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pid1Q3UBG2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pid1Q3UBG2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pid1Q3UBG2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pid1Q3UBG2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pid1Q3UBG2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pid1Q3UBG2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pid1Q3UBG2 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pid1Q3UBG2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pid1Q3UBG2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pid1Q3UBG2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pid1Q3UBG2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pid1Q3UBG2 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pid1Q3UBG2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pid1Q3UBG2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Pid1Q3UBG2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pid1Q3UBG2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pid1Q3UBG2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pid1Q3UBG2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pid1Q3UBG2 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pid1Q3UBG2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pid1Q3UBG2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pid1Q3UBG2 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pid1Q3UBG2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pid1Q3UBG2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pid1Q3UBG2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pid1Q3UBG2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pid1Q3UBG2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pid1Q3UBG2 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Pid1Q3UBG2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pid1Q3UBG2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pid1Q3UBG2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pid1Q3UBG2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pid1Q3UBG2 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pid1Q3UBG2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pid1Q3UBG2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pid1Q3UBG2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pid1Q3UBG2 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pid1Q3UBG2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pid1Q3UBG2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pid1Q3UBG2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pid1Q3UBG2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pid1Q3UBG2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pid1Q3UBG2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pid1Q3UBG2 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pid1Q3UBG2 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pid1Q3UBG2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pid1Q3UBG2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pid1Q3UBG2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pid1Q3UBG2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pid1Q3UBG2 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pid1Q3UBG2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pid1Q3UBG2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pid1Q3UBG2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Pid1Q3UBG2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pid1Q3UBG2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pid1Q3UBG2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Pid1Q3UBG2 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pid1Q3UBG2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pid1Q3UBG2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pid1Q3UBG2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pid1Q3UBG2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pid1Q3UBG2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pid1Q3UBG2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pid1Q3UBG2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pid1Q3UBG2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pid1Q3UBG2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pid1Q3UBG2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pid1Q3UBG2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pid1Q3UBG2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pid1Q3UBG2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pid1Q3UBG2 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pid1Q3UBG2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pid1Q3UBG2 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pid1Q3UBG2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pid1Q3UBG2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Pid1Q3UBG2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pid1Q3UBG2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pid1Q3UBG2 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pid1Q3UBG2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pid1Q3UBG2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pid1Q3UBG2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pid1Q3UBG2 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pid1Q3UBG2 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pid1Q3UBG2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pid1Q3UBG2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pid1Q3UBG2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms