Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf180Q3U827 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf180Q3U827 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf180Q3U827 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf180Q3U827 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf180Q3U827 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf180Q3U827 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf180Q3U827 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf180Q3U827 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf180Q3U827 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf180Q3U827 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf180Q3U827 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf180Q3U827 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf180Q3U827 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf180Q3U827 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnf180Q3U827 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnf180Q3U827 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnf180Q3U827 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnf180Q3U827 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnf180Q3U827 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnf180Q3U827 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnf180Q3U827 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnf180Q3U827 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnf180Q3U827 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf180Q3U827 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf180Q3U827 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf180Q3U827 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf180Q3U827 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf180Q3U827 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf180Q3U827 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf180Q3U827 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf180Q3U827 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf180Q3U827 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf180Q3U827 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf180Q3U827 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf180Q3U827 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf180Q3U827 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rnf180Q3U827 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rnf180Q3U827 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rnf180Q3U827 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rnf180Q3U827 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rnf180Q3U827 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Rnf180Q3U827 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rnf180Q3U827 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rnf180Q3U827 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rnf180Q3U827 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rnf180Q3U827 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rnf180Q3U827 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rnf180Q3U827 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rnf180Q3U827 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rnf180Q3U827 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rnf180Q3U827 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rnf180Q3U827 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rnf180Q3U827 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rnf180Q3U827 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rnf180Q3U827 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnf180Q3U827 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnf180Q3U827 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnf180Q3U827 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnf180Q3U827 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnf180Q3U827 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnf180Q3U827 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnf180Q3U827 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnf180Q3U827 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnf180Q3U827 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnf180Q3U827 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnf180Q3U827 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnf180Q3U827 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnf180Q3U827 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnf180Q3U827 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnf180Q3U827 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnf180Q3U827 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnf180Q3U827 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnf180Q3U827 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnf180Q3U827 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnf180Q3U827 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnf180Q3U827 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnf180Q3U827 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnf180Q3U827 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnf180Q3U827 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rnf180Q3U827 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rnf180Q3U827 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rnf180Q3U827 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rnf180Q3U827 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rnf180Q3U827 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnf180Q3U827 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnf180Q3U827 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnf180Q3U827 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnf180Q3U827 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnf180Q3U827 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnf180Q3U827 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnf180Q3U827 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnf180Q3U827 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnf180Q3U827 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnf180Q3U827 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf180Q3U827 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf180Q3U827 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf180Q3U827 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf180Q3U827 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf180Q3U827 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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