Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWL2

Pip4p1, Type 1 phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 4-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pip4p1Q3TWL2 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pip4p1Q3TWL2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pip4p1Q3TWL2 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pip4p1Q3TWL2 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pip4p1Q3TWL2 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pip4p1Q3TWL2 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pip4p1Q3TWL2 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pip4p1Q3TWL2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pip4p1Q3TWL2 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pip4p1Q3TWL2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pip4p1Q3TWL2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pip4p1Q3TWL2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pip4p1Q3TWL2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pip4p1Q3TWL2 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pip4p1Q3TWL2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pip4p1Q3TWL2 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pip4p1Q3TWL2 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pip4p1Q3TWL2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pip4p1Q3TWL2 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pip4p1Q3TWL2 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pip4p1Q3TWL2 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pip4p1Q3TWL2 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pip4p1Q3TWL2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pip4p1Q3TWL2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pip4p1Q3TWL2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pip4p1Q3TWL2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pip4p1Q3TWL2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pip4p1Q3TWL2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pip4p1Q3TWL2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pip4p1Q3TWL2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pip4p1Q3TWL2 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pip4p1Q3TWL2 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pip4p1Q3TWL2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pip4p1Q3TWL2 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pip4p1Q3TWL2 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pip4p1Q3TWL2 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pip4p1Q3TWL2 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pip4p1Q3TWL2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pip4p1Q3TWL2 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pip4p1Q3TWL2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pip4p1Q3TWL2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pip4p1Q3TWL2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pip4p1Q3TWL2 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pip4p1Q3TWL2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pip4p1Q3TWL2 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pip4p1Q3TWL2 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pip4p1Q3TWL2 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pip4p1Q3TWL2 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pip4p1Q3TWL2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pip4p1Q3TWL2 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pip4p1Q3TWL2 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pip4p1Q3TWL2 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pip4p1Q3TWL2 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pip4p1Q3TWL2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pip4p1Q3TWL2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pip4p1Q3TWL2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pip4p1Q3TWL2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pip4p1Q3TWL2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pip4p1Q3TWL2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pip4p1Q3TWL2 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pip4p1Q3TWL2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pip4p1Q3TWL2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pip4p1Q3TWL2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pip4p1Q3TWL2 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pip4p1Q3TWL2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pip4p1Q3TWL2 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pip4p1Q3TWL2 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pip4p1Q3TWL2 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pip4p1Q3TWL2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pip4p1Q3TWL2 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pip4p1Q3TWL2 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pip4p1Q3TWL2 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pip4p1Q3TWL2 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pip4p1Q3TWL2 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pip4p1Q3TWL2 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pip4p1Q3TWL2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pip4p1Q3TWL2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pip4p1Q3TWL2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pip4p1Q3TWL2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pip4p1Q3TWL2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pip4p1Q3TWL2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pip4p1Q3TWL2 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pip4p1Q3TWL2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pip4p1Q3TWL2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pip4p1Q3TWL2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pip4p1Q3TWL2 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pip4p1Q3TWL2 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pip4p1Q3TWL2 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pip4p1Q3TWL2 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pip4p1Q3TWL2 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pip4p1Q3TWL2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pip4p1Q3TWL2 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pip4p1Q3TWL2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pip4p1Q3TWL2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pip4p1Q3TWL2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pip4p1Q3TWL2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pip4p1Q3TWL2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pip4p1Q3TWL2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pip4p1Q3TWL2 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pip4p1Q3TWL2 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms