Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cpne9Q1RLL3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cpne9Q1RLL3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cpne9Q1RLL3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cpne9Q1RLL3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Cpne9Q1RLL3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpne9Q1RLL3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpne9Q1RLL3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpne9Q1RLL3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpne9Q1RLL3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpne9Q1RLL3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpne9Q1RLL3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpne9Q1RLL3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpne9Q1RLL3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpne9Q1RLL3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpne9Q1RLL3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpne9Q1RLL3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpne9Q1RLL3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpne9Q1RLL3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpne9Q1RLL3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpne9Q1RLL3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpne9Q1RLL3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpne9Q1RLL3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpne9Q1RLL3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpne9Q1RLL3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpne9Q1RLL3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpne9Q1RLL3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpne9Q1RLL3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpne9Q1RLL3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpne9Q1RLL3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpne9Q1RLL3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpne9Q1RLL3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpne9Q1RLL3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpne9Q1RLL3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpne9Q1RLL3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpne9Q1RLL3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpne9Q1RLL3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpne9Q1RLL3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpne9Q1RLL3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpne9Q1RLL3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpne9Q1RLL3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpne9Q1RLL3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpne9Q1RLL3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpne9Q1RLL3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpne9Q1RLL3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpne9Q1RLL3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpne9Q1RLL3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpne9Q1RLL3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpne9Q1RLL3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpne9Q1RLL3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpne9Q1RLL3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpne9Q1RLL3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpne9Q1RLL3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpne9Q1RLL3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpne9Q1RLL3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpne9Q1RLL3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpne9Q1RLL3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpne9Q1RLL3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpne9Q1RLL3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpne9Q1RLL3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpne9Q1RLL3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpne9Q1RLL3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpne9Q1RLL3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpne9Q1RLL3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpne9Q1RLL3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpne9Q1RLL3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpne9Q1RLL3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpne9Q1RLL3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpne9Q1RLL3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpne9Q1RLL3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cpne9Q1RLL3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cpne9Q1RLL3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cpne9Q1RLL3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cpne9Q1RLL3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cpne9Q1RLL3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cpne9Q1RLL3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cpne9Q1RLL3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cpne9Q1RLL3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cpne9Q1RLL3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cpne9Q1RLL3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cpne9Q1RLL3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cpne9Q1RLL3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cpne9Q1RLL3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cpne9Q1RLL3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cpne9Q1RLL3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpne9Q1RLL3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpne9Q1RLL3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpne9Q1RLL3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpne9Q1RLL3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpne9Q1RLL3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpne9Q1RLL3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpne9Q1RLL3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpne9Q1RLL3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpne9Q1RLL3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpne9Q1RLL3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpne9Q1RLL3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpne9Q1RLL3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpne9Q1RLL3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpne9Q1RLL3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpne9Q1RLL3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms